Protein–RNA interactions for Protein: F2Z461

Herc6, E3 ISG15--protein ligase Herc6, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc6F2Z461 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Herc6F2Z461 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Herc6F2Z461 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Herc6F2Z461 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Herc6F2Z461 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Herc6F2Z461 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Herc6F2Z461 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Herc6F2Z461 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Herc6F2Z461 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Herc6F2Z461 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Herc6F2Z461 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Herc6F2Z461 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Herc6F2Z461 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Herc6F2Z461 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Herc6F2Z461 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Herc6F2Z461 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Herc6F2Z461 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Herc6F2Z461 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Herc6F2Z461 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Herc6F2Z461 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Herc6F2Z461 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Herc6F2Z461 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Herc6F2Z461 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Herc6F2Z461 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Herc6F2Z461 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Herc6F2Z461 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Herc6F2Z461 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Herc6F2Z461 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Herc6F2Z461 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Herc6F2Z461 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Herc6F2Z461 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Herc6F2Z461 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Herc6F2Z461 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Herc6F2Z461 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Herc6F2Z461 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Herc6F2Z461 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Herc6F2Z461 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Herc6F2Z461 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Herc6F2Z461 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Herc6F2Z461 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Herc6F2Z461 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Herc6F2Z461 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Herc6F2Z461 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Herc6F2Z461 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Herc6F2Z461 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Herc6F2Z461 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Herc6F2Z461 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Herc6F2Z461 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Herc6F2Z461 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Herc6F2Z461 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Herc6F2Z461 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Herc6F2Z461 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Herc6F2Z461 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Herc6F2Z461 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Herc6F2Z461 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Herc6F2Z461 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Herc6F2Z461 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Herc6F2Z461 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Herc6F2Z461 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Herc6F2Z461 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Herc6F2Z461 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Herc6F2Z461 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Herc6F2Z461 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Herc6F2Z461 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Herc6F2Z461 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Herc6F2Z461 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Herc6F2Z461 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Herc6F2Z461 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Herc6F2Z461 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Herc6F2Z461 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Herc6F2Z461 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Herc6F2Z461 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Herc6F2Z461 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Herc6F2Z461 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Herc6F2Z461 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Herc6F2Z461 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Herc6F2Z461 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Herc6F2Z461 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Herc6F2Z461 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Herc6F2Z461 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Herc6F2Z461 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Herc6F2Z461 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Herc6F2Z461 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Herc6F2Z461 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Herc6F2Z461 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Herc6F2Z461 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Herc6F2Z461 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Herc6F2Z461 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Herc6F2Z461 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Herc6F2Z461 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Herc6F2Z461 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Herc6F2Z461 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Herc6F2Z461 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Herc6F2Z461 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Herc6F2Z461 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Herc6F2Z461 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Herc6F2Z461 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Herc6F2Z461 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Herc6F2Z461 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Herc6F2Z461 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms