Protein–RNA interactions for Protein: E9QA62

Lmod3, Leiomodin-3, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod3E9QA62 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lmod3E9QA62 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lmod3E9QA62 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lmod3E9QA62 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lmod3E9QA62 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lmod3E9QA62 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lmod3E9QA62 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lmod3E9QA62 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lmod3E9QA62 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lmod3E9QA62 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lmod3E9QA62 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lmod3E9QA62 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lmod3E9QA62 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lmod3E9QA62 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lmod3E9QA62 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lmod3E9QA62 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lmod3E9QA62 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lmod3E9QA62 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lmod3E9QA62 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lmod3E9QA62 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lmod3E9QA62 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lmod3E9QA62 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lmod3E9QA62 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lmod3E9QA62 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lmod3E9QA62 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lmod3E9QA62 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lmod3E9QA62 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lmod3E9QA62 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lmod3E9QA62 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lmod3E9QA62 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lmod3E9QA62 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lmod3E9QA62 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lmod3E9QA62 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lmod3E9QA62 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lmod3E9QA62 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lmod3E9QA62 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lmod3E9QA62 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lmod3E9QA62 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lmod3E9QA62 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lmod3E9QA62 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lmod3E9QA62 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lmod3E9QA62 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lmod3E9QA62 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Lmod3E9QA62 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Lmod3E9QA62 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lmod3E9QA62 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Lmod3E9QA62 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lmod3E9QA62 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lmod3E9QA62 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Lmod3E9QA62 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lmod3E9QA62 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lmod3E9QA62 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lmod3E9QA62 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lmod3E9QA62 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lmod3E9QA62 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lmod3E9QA62 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lmod3E9QA62 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lmod3E9QA62 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lmod3E9QA62 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lmod3E9QA62 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lmod3E9QA62 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lmod3E9QA62 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lmod3E9QA62 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lmod3E9QA62 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lmod3E9QA62 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lmod3E9QA62 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lmod3E9QA62 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lmod3E9QA62 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lmod3E9QA62 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lmod3E9QA62 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lmod3E9QA62 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lmod3E9QA62 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lmod3E9QA62 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Lmod3E9QA62 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lmod3E9QA62 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lmod3E9QA62 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lmod3E9QA62 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lmod3E9QA62 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lmod3E9QA62 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lmod3E9QA62 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lmod3E9QA62 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lmod3E9QA62 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lmod3E9QA62 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lmod3E9QA62 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lmod3E9QA62 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lmod3E9QA62 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lmod3E9QA62 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lmod3E9QA62 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lmod3E9QA62 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lmod3E9QA62 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lmod3E9QA62 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lmod3E9QA62 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lmod3E9QA62 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lmod3E9QA62 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lmod3E9QA62 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lmod3E9QA62 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lmod3E9QA62 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lmod3E9QA62 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lmod3E9QA62 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lmod3E9QA62 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms