Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9W7

Pdzd7, PDZ domain-containing 7, mousemouse

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Length 1,021 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd7E9Q9W7 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdzd7E9Q9W7 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdzd7E9Q9W7 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdzd7E9Q9W7 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdzd7E9Q9W7 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdzd7E9Q9W7 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdzd7E9Q9W7 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdzd7E9Q9W7 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdzd7E9Q9W7 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdzd7E9Q9W7 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdzd7E9Q9W7 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdzd7E9Q9W7 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdzd7E9Q9W7 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdzd7E9Q9W7 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdzd7E9Q9W7 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdzd7E9Q9W7 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdzd7E9Q9W7 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Pdzd7E9Q9W7 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdzd7E9Q9W7 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdzd7E9Q9W7 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdzd7E9Q9W7 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdzd7E9Q9W7 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdzd7E9Q9W7 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdzd7E9Q9W7 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdzd7E9Q9W7 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdzd7E9Q9W7 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdzd7E9Q9W7 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdzd7E9Q9W7 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdzd7E9Q9W7 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdzd7E9Q9W7 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdzd7E9Q9W7 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Pdzd7E9Q9W7 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdzd7E9Q9W7 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Pdzd7E9Q9W7 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdzd7E9Q9W7 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdzd7E9Q9W7 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdzd7E9Q9W7 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdzd7E9Q9W7 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdzd7E9Q9W7 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdzd7E9Q9W7 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdzd7E9Q9W7 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdzd7E9Q9W7 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdzd7E9Q9W7 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdzd7E9Q9W7 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdzd7E9Q9W7 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Pdzd7E9Q9W7 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdzd7E9Q9W7 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Pdzd7E9Q9W7 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Pdzd7E9Q9W7 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdzd7E9Q9W7 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdzd7E9Q9W7 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Pdzd7E9Q9W7 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdzd7E9Q9W7 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdzd7E9Q9W7 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdzd7E9Q9W7 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdzd7E9Q9W7 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdzd7E9Q9W7 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdzd7E9Q9W7 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdzd7E9Q9W7 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Pdzd7E9Q9W7 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdzd7E9Q9W7 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdzd7E9Q9W7 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdzd7E9Q9W7 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdzd7E9Q9W7 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdzd7E9Q9W7 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdzd7E9Q9W7 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdzd7E9Q9W7 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdzd7E9Q9W7 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdzd7E9Q9W7 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdzd7E9Q9W7 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdzd7E9Q9W7 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdzd7E9Q9W7 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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