Protein–RNA interactions for Protein: E9Q8F9

6030445D17Rik, RIKEN cDNA 6030445D17 gene, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6030445D17RikE9Q8F9 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC9.35□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC9.35□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC9.34□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms