Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7L1

Urb2, URB2 ribosome biogenesis 2 homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb2E9Q7L1 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Urb2E9Q7L1 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Urb2E9Q7L1 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Urb2E9Q7L1 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Urb2E9Q7L1 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Urb2E9Q7L1 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Urb2E9Q7L1 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Urb2E9Q7L1 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Urb2E9Q7L1 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Urb2E9Q7L1 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Urb2E9Q7L1 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Urb2E9Q7L1 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Urb2E9Q7L1 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Urb2E9Q7L1 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Urb2E9Q7L1 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Urb2E9Q7L1 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Urb2E9Q7L1 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Urb2E9Q7L1 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Urb2E9Q7L1 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Urb2E9Q7L1 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Urb2E9Q7L1 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Urb2E9Q7L1 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Urb2E9Q7L1 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Urb2E9Q7L1 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Urb2E9Q7L1 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Urb2E9Q7L1 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Urb2E9Q7L1 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Urb2E9Q7L1 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Urb2E9Q7L1 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Urb2E9Q7L1 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Urb2E9Q7L1 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Urb2E9Q7L1 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Urb2E9Q7L1 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Urb2E9Q7L1 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Urb2E9Q7L1 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Urb2E9Q7L1 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Urb2E9Q7L1 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Urb2E9Q7L1 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Urb2E9Q7L1 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Urb2E9Q7L1 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Urb2E9Q7L1 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Urb2E9Q7L1 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Urb2E9Q7L1 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Urb2E9Q7L1 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Urb2E9Q7L1 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Urb2E9Q7L1 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Urb2E9Q7L1 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Urb2E9Q7L1 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Urb2E9Q7L1 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Urb2E9Q7L1 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Urb2E9Q7L1 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Urb2E9Q7L1 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Urb2E9Q7L1 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Urb2E9Q7L1 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Urb2E9Q7L1 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Urb2E9Q7L1 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Urb2E9Q7L1 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Urb2E9Q7L1 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Urb2E9Q7L1 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Urb2E9Q7L1 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Urb2E9Q7L1 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Urb2E9Q7L1 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Urb2E9Q7L1 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Urb2E9Q7L1 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Urb2E9Q7L1 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Urb2E9Q7L1 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Urb2E9Q7L1 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Urb2E9Q7L1 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Urb2E9Q7L1 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Urb2E9Q7L1 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Urb2E9Q7L1 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Urb2E9Q7L1 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Urb2E9Q7L1 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Urb2E9Q7L1 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Urb2E9Q7L1 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Urb2E9Q7L1 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Urb2E9Q7L1 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Urb2E9Q7L1 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Urb2E9Q7L1 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Urb2E9Q7L1 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Urb2E9Q7L1 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Urb2E9Q7L1 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Urb2E9Q7L1 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Urb2E9Q7L1 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Urb2E9Q7L1 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Urb2E9Q7L1 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Urb2E9Q7L1 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Urb2E9Q7L1 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Urb2E9Q7L1 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Urb2E9Q7L1 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Urb2E9Q7L1 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Urb2E9Q7L1 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Urb2E9Q7L1 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Urb2E9Q7L1 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Urb2E9Q7L1 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Urb2E9Q7L1 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Urb2E9Q7L1 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Urb2E9Q7L1 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Urb2E9Q7L1 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Urb2E9Q7L1 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms