Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6B2

Ccdc85c, Coiled-coil domain-containing protein 85C, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85cE9Q6B2 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc85cE9Q6B2 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc85cE9Q6B2 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc85cE9Q6B2 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc85cE9Q6B2 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc85cE9Q6B2 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc85cE9Q6B2 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc85cE9Q6B2 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc85cE9Q6B2 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc85cE9Q6B2 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc85cE9Q6B2 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc85cE9Q6B2 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc85cE9Q6B2 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc85cE9Q6B2 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc85cE9Q6B2 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc85cE9Q6B2 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc85cE9Q6B2 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc85cE9Q6B2 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc85cE9Q6B2 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc85cE9Q6B2 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc85cE9Q6B2 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc85cE9Q6B2 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc85cE9Q6B2 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc85cE9Q6B2 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc85cE9Q6B2 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc85cE9Q6B2 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc85cE9Q6B2 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc85cE9Q6B2 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc85cE9Q6B2 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc85cE9Q6B2 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc85cE9Q6B2 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc85cE9Q6B2 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc85cE9Q6B2 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc85cE9Q6B2 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc85cE9Q6B2 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc85cE9Q6B2 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc85cE9Q6B2 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc85cE9Q6B2 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc85cE9Q6B2 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc85cE9Q6B2 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc85cE9Q6B2 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc85cE9Q6B2 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc85cE9Q6B2 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc85cE9Q6B2 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc85cE9Q6B2 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc85cE9Q6B2 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc85cE9Q6B2 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc85cE9Q6B2 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc85cE9Q6B2 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc85cE9Q6B2 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc85cE9Q6B2 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc85cE9Q6B2 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc85cE9Q6B2 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc85cE9Q6B2 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc85cE9Q6B2 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc85cE9Q6B2 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc85cE9Q6B2 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc85cE9Q6B2 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc85cE9Q6B2 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc85cE9Q6B2 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc85cE9Q6B2 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc85cE9Q6B2 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc85cE9Q6B2 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc85cE9Q6B2 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc85cE9Q6B2 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc85cE9Q6B2 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc85cE9Q6B2 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc85cE9Q6B2 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc85cE9Q6B2 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc85cE9Q6B2 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc85cE9Q6B2 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc85cE9Q6B2 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc85cE9Q6B2 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc85cE9Q6B2 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc85cE9Q6B2 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc85cE9Q6B2 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc85cE9Q6B2 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc85cE9Q6B2 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc85cE9Q6B2 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc85cE9Q6B2 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc85cE9Q6B2 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc85cE9Q6B2 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc85cE9Q6B2 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc85cE9Q6B2 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc85cE9Q6B2 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc85cE9Q6B2 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc85cE9Q6B2 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc85cE9Q6B2 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc85cE9Q6B2 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc85cE9Q6B2 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc85cE9Q6B2 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc85cE9Q6B2 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc85cE9Q6B2 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc85cE9Q6B2 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc85cE9Q6B2 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc85cE9Q6B2 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc85cE9Q6B2 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc85cE9Q6B2 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc85cE9Q6B2 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc85cE9Q6B2 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms