Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5E2

BC005561, cDNA sequence BC005561, mousemouse

Predictions only

Length 1,589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC005561E9Q5E2 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BC005561E9Q5E2 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BC005561E9Q5E2 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BC005561E9Q5E2 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BC005561E9Q5E2 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BC005561E9Q5E2 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BC005561E9Q5E2 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BC005561E9Q5E2 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BC005561E9Q5E2 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BC005561E9Q5E2 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BC005561E9Q5E2 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BC005561E9Q5E2 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BC005561E9Q5E2 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BC005561E9Q5E2 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BC005561E9Q5E2 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BC005561E9Q5E2 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BC005561E9Q5E2 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
BC005561E9Q5E2 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BC005561E9Q5E2 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BC005561E9Q5E2 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BC005561E9Q5E2 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BC005561E9Q5E2 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BC005561E9Q5E2 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
BC005561E9Q5E2 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BC005561E9Q5E2 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BC005561E9Q5E2 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
BC005561E9Q5E2 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BC005561E9Q5E2 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BC005561E9Q5E2 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BC005561E9Q5E2 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BC005561E9Q5E2 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BC005561E9Q5E2 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
BC005561E9Q5E2 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BC005561E9Q5E2 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BC005561E9Q5E2 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BC005561E9Q5E2 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BC005561E9Q5E2 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BC005561E9Q5E2 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BC005561E9Q5E2 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BC005561E9Q5E2 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BC005561E9Q5E2 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BC005561E9Q5E2 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BC005561E9Q5E2 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
BC005561E9Q5E2 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BC005561E9Q5E2 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BC005561E9Q5E2 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
BC005561E9Q5E2 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BC005561E9Q5E2 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BC005561E9Q5E2 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BC005561E9Q5E2 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BC005561E9Q5E2 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BC005561E9Q5E2 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
BC005561E9Q5E2 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BC005561E9Q5E2 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BC005561E9Q5E2 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BC005561E9Q5E2 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BC005561E9Q5E2 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BC005561E9Q5E2 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BC005561E9Q5E2 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BC005561E9Q5E2 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BC005561E9Q5E2 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BC005561E9Q5E2 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BC005561E9Q5E2 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BC005561E9Q5E2 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BC005561E9Q5E2 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BC005561E9Q5E2 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BC005561E9Q5E2 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BC005561E9Q5E2 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BC005561E9Q5E2 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BC005561E9Q5E2 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BC005561E9Q5E2 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BC005561E9Q5E2 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BC005561E9Q5E2 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
BC005561E9Q5E2 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BC005561E9Q5E2 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
BC005561E9Q5E2 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BC005561E9Q5E2 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BC005561E9Q5E2 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BC005561E9Q5E2 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BC005561E9Q5E2 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BC005561E9Q5E2 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BC005561E9Q5E2 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BC005561E9Q5E2 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BC005561E9Q5E2 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
BC005561E9Q5E2 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BC005561E9Q5E2 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BC005561E9Q5E2 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BC005561E9Q5E2 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BC005561E9Q5E2 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BC005561E9Q5E2 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
BC005561E9Q5E2 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BC005561E9Q5E2 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BC005561E9Q5E2 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BC005561E9Q5E2 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BC005561E9Q5E2 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BC005561E9Q5E2 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BC005561E9Q5E2 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BC005561E9Q5E2 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BC005561E9Q5E2 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BC005561E9Q5E2 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms