Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4T4

Ccdc71l, Coiled-coil domain-containing 71-like, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71lE9Q4T4 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Ccdc71lE9Q4T4 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc71lE9Q4T4 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc71lE9Q4T4 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc71lE9Q4T4 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc71lE9Q4T4 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc71lE9Q4T4 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Ccdc71lE9Q4T4 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc71lE9Q4T4 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc71lE9Q4T4 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc71lE9Q4T4 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc71lE9Q4T4 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc71lE9Q4T4 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
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Ccdc71lE9Q4T4 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc71lE9Q4T4 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Ccdc71lE9Q4T4 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc71lE9Q4T4 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc71lE9Q4T4 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Ccdc71lE9Q4T4 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Ccdc71lE9Q4T4 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc71lE9Q4T4 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc71lE9Q4T4 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc71lE9Q4T4 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc71lE9Q4T4 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc71lE9Q4T4 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc71lE9Q4T4 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc71lE9Q4T4 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc71lE9Q4T4 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc71lE9Q4T4 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc71lE9Q4T4 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc71lE9Q4T4 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc71lE9Q4T4 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc71lE9Q4T4 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc71lE9Q4T4 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc71lE9Q4T4 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc71lE9Q4T4 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc71lE9Q4T4 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
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