Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ54

Gcom1, GRINL1A complex locus, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcom1E9PZ54 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gcom1E9PZ54 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gcom1E9PZ54 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gcom1E9PZ54 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gcom1E9PZ54 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gcom1E9PZ54 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gcom1E9PZ54 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gcom1E9PZ54 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gcom1E9PZ54 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gcom1E9PZ54 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gcom1E9PZ54 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gcom1E9PZ54 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gcom1E9PZ54 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gcom1E9PZ54 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gcom1E9PZ54 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gcom1E9PZ54 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gcom1E9PZ54 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gcom1E9PZ54 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gcom1E9PZ54 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gcom1E9PZ54 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gcom1E9PZ54 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gcom1E9PZ54 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gcom1E9PZ54 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gcom1E9PZ54 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gcom1E9PZ54 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gcom1E9PZ54 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gcom1E9PZ54 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gcom1E9PZ54 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gcom1E9PZ54 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gcom1E9PZ54 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gcom1E9PZ54 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gcom1E9PZ54 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gcom1E9PZ54 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gcom1E9PZ54 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gcom1E9PZ54 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gcom1E9PZ54 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gcom1E9PZ54 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gcom1E9PZ54 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gcom1E9PZ54 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gcom1E9PZ54 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gcom1E9PZ54 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gcom1E9PZ54 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gcom1E9PZ54 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gcom1E9PZ54 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gcom1E9PZ54 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gcom1E9PZ54 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gcom1E9PZ54 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gcom1E9PZ54 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gcom1E9PZ54 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gcom1E9PZ54 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gcom1E9PZ54 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gcom1E9PZ54 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gcom1E9PZ54 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gcom1E9PZ54 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gcom1E9PZ54 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gcom1E9PZ54 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gcom1E9PZ54 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gcom1E9PZ54 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gcom1E9PZ54 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gcom1E9PZ54 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gcom1E9PZ54 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gcom1E9PZ54 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gcom1E9PZ54 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gcom1E9PZ54 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gcom1E9PZ54 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gcom1E9PZ54 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gcom1E9PZ54 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Gcom1E9PZ54 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gcom1E9PZ54 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gcom1E9PZ54 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gcom1E9PZ54 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gcom1E9PZ54 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gcom1E9PZ54 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gcom1E9PZ54 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gcom1E9PZ54 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gcom1E9PZ54 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gcom1E9PZ54 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gcom1E9PZ54 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gcom1E9PZ54 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gcom1E9PZ54 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Gcom1E9PZ54 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gcom1E9PZ54 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Gcom1E9PZ54 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gcom1E9PZ54 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gcom1E9PZ54 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gcom1E9PZ54 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gcom1E9PZ54 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gcom1E9PZ54 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gcom1E9PZ54 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gcom1E9PZ54 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gcom1E9PZ54 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gcom1E9PZ54 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gcom1E9PZ54 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gcom1E9PZ54 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gcom1E9PZ54 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gcom1E9PZ54 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gcom1E9PZ54 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gcom1E9PZ54 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gcom1E9PZ54 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gcom1E9PZ54 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms