Protein–RNA interactions for Protein: E9PW80

Gm3298, Predicted gene 3298, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3298E9PW80 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3298E9PW80 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3298E9PW80 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3298E9PW80 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3298E9PW80 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3298E9PW80 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3298E9PW80 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3298E9PW80 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Gm3298E9PW80 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3298E9PW80 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3298E9PW80 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3298E9PW80 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Gm3298E9PW80 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3298E9PW80 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Gm3298E9PW80 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3298E9PW80 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3298E9PW80 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Gm3298E9PW80 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3298E9PW80 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3298E9PW80 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3298E9PW80 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3298E9PW80 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3298E9PW80 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3298E9PW80 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3298E9PW80 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Gm3298E9PW80 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3298E9PW80 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Gm3298E9PW80 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3298E9PW80 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3298E9PW80 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3298E9PW80 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Gm3298E9PW80 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Gm3298E9PW80 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Gm3298E9PW80 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3298E9PW80 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Gm3298E9PW80 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Gm3298E9PW80 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3298E9PW80 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Gm3298E9PW80 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Gm3298E9PW80 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3298E9PW80 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3298E9PW80 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3298E9PW80 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3298E9PW80 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3298E9PW80 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3298E9PW80 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3298E9PW80 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3298E9PW80 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3298E9PW80 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3298E9PW80 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3298E9PW80 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3298E9PW80 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3298E9PW80 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3298E9PW80 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3298E9PW80 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3298E9PW80 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3298E9PW80 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3298E9PW80 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3298E9PW80 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3298E9PW80 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3298E9PW80 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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