Protein–RNA interactions for Protein: E9PUU5

Zfp839, Zinc finger protein 839, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp839E9PUU5 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp839E9PUU5 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp839E9PUU5 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp839E9PUU5 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp839E9PUU5 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp839E9PUU5 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp839E9PUU5 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp839E9PUU5 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp839E9PUU5 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp839E9PUU5 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp839E9PUU5 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp839E9PUU5 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp839E9PUU5 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp839E9PUU5 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp839E9PUU5 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp839E9PUU5 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp839E9PUU5 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp839E9PUU5 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp839E9PUU5 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp839E9PUU5 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp839E9PUU5 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp839E9PUU5 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp839E9PUU5 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp839E9PUU5 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp839E9PUU5 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp839E9PUU5 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp839E9PUU5 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp839E9PUU5 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp839E9PUU5 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp839E9PUU5 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp839E9PUU5 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp839E9PUU5 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp839E9PUU5 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp839E9PUU5 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp839E9PUU5 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp839E9PUU5 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp839E9PUU5 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp839E9PUU5 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp839E9PUU5 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp839E9PUU5 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp839E9PUU5 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp839E9PUU5 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp839E9PUU5 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp839E9PUU5 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp839E9PUU5 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp839E9PUU5 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp839E9PUU5 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp839E9PUU5 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp839E9PUU5 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp839E9PUU5 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp839E9PUU5 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp839E9PUU5 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp839E9PUU5 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp839E9PUU5 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp839E9PUU5 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp839E9PUU5 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp839E9PUU5 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp839E9PUU5 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp839E9PUU5 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp839E9PUU5 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp839E9PUU5 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp839E9PUU5 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp839E9PUU5 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp839E9PUU5 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp839E9PUU5 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp839E9PUU5 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp839E9PUU5 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp839E9PUU5 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp839E9PUU5 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp839E9PUU5 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp839E9PUU5 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp839E9PUU5 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp839E9PUU5 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp839E9PUU5 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp839E9PUU5 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp839E9PUU5 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp839E9PUU5 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp839E9PUU5 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp839E9PUU5 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp839E9PUU5 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp839E9PUU5 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp839E9PUU5 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp839E9PUU5 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp839E9PUU5 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp839E9PUU5 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp839E9PUU5 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp839E9PUU5 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zfp839E9PUU5 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zfp839E9PUU5 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zfp839E9PUU5 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zfp839E9PUU5 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zfp839E9PUU5 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Zfp839E9PUU5 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zfp839E9PUU5 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zfp839E9PUU5 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zfp839E9PUU5 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zfp839E9PUU5 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Zfp839E9PUU5 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zfp839E9PUU5 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zfp839E9PUU5 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms