Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms