Protein–RNA interactions for Protein: D3Z235

Gm3543, Predicted gene 3543, mousemouse

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Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3543D3Z235 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3543D3Z235 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3543D3Z235 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3543D3Z235 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3543D3Z235 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3543D3Z235 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3543D3Z235 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3543D3Z235 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3543D3Z235 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3543D3Z235 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3543D3Z235 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3543D3Z235 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3543D3Z235 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3543D3Z235 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3543D3Z235 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3543D3Z235 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3543D3Z235 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3543D3Z235 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3543D3Z235 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3543D3Z235 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3543D3Z235 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3543D3Z235 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3543D3Z235 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3543D3Z235 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3543D3Z235 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3543D3Z235 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3543D3Z235 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3543D3Z235 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3543D3Z235 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm3543D3Z235 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm3543D3Z235 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm3543D3Z235 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm3543D3Z235 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm3543D3Z235 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm3543D3Z235 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm3543D3Z235 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm3543D3Z235 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm3543D3Z235 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm3543D3Z235 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm3543D3Z235 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm3543D3Z235 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm3543D3Z235 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm3543D3Z235 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm3543D3Z235 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm3543D3Z235 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm3543D3Z235 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm3543D3Z235 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm3543D3Z235 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm3543D3Z235 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm3543D3Z235 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm3543D3Z235 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm3543D3Z235 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm3543D3Z235 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm3543D3Z235 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm3543D3Z235 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm3543D3Z235 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Gm3543D3Z235 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3543D3Z235 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3543D3Z235 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3543D3Z235 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3543D3Z235 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3543D3Z235 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3543D3Z235 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3543D3Z235 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3543D3Z235 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3543D3Z235 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3543D3Z235 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3543D3Z235 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3543D3Z235 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3543D3Z235 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3543D3Z235 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3543D3Z235 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3543D3Z235 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3543D3Z235 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3543D3Z235 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3543D3Z235 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3543D3Z235 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3543D3Z235 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3543D3Z235 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3543D3Z235 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3543D3Z235 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3543D3Z235 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3543D3Z235 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3543D3Z235 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3543D3Z235 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3543D3Z235 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3543D3Z235 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3543D3Z235 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3543D3Z235 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3543D3Z235 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3543D3Z235 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3543D3Z235 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3543D3Z235 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3543D3Z235 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3543D3Z235 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3543D3Z235 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3543D3Z235 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3543D3Z235 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3543D3Z235 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3543D3Z235 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
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