Protein–RNA interactions for Protein: B7XG49

Fam71a, Family with sequence similarity 71, member A, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam71aB7XG49 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam71aB7XG49 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam71aB7XG49 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam71aB7XG49 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam71aB7XG49 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam71aB7XG49 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam71aB7XG49 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam71aB7XG49 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam71aB7XG49 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam71aB7XG49 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam71aB7XG49 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam71aB7XG49 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam71aB7XG49 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam71aB7XG49 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam71aB7XG49 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam71aB7XG49 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam71aB7XG49 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam71aB7XG49 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam71aB7XG49 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam71aB7XG49 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam71aB7XG49 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam71aB7XG49 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam71aB7XG49 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam71aB7XG49 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam71aB7XG49 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam71aB7XG49 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam71aB7XG49 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam71aB7XG49 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam71aB7XG49 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam71aB7XG49 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam71aB7XG49 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam71aB7XG49 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fam71aB7XG49 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fam71aB7XG49 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fam71aB7XG49 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fam71aB7XG49 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fam71aB7XG49 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fam71aB7XG49 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fam71aB7XG49 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fam71aB7XG49 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fam71aB7XG49 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fam71aB7XG49 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fam71aB7XG49 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Fam71aB7XG49 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fam71aB7XG49 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Fam71aB7XG49 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fam71aB7XG49 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fam71aB7XG49 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fam71aB7XG49 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fam71aB7XG49 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fam71aB7XG49 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fam71aB7XG49 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fam71aB7XG49 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fam71aB7XG49 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fam71aB7XG49 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fam71aB7XG49 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fam71aB7XG49 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fam71aB7XG49 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fam71aB7XG49 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fam71aB7XG49 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fam71aB7XG49 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fam71aB7XG49 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fam71aB7XG49 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fam71aB7XG49 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fam71aB7XG49 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fam71aB7XG49 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fam71aB7XG49 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fam71aB7XG49 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fam71aB7XG49 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fam71aB7XG49 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fam71aB7XG49 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fam71aB7XG49 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fam71aB7XG49 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fam71aB7XG49 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fam71aB7XG49 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fam71aB7XG49 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Fam71aB7XG49 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fam71aB7XG49 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Fam71aB7XG49 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fam71aB7XG49 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fam71aB7XG49 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fam71aB7XG49 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fam71aB7XG49 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fam71aB7XG49 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fam71aB7XG49 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Fam71aB7XG49 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fam71aB7XG49 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fam71aB7XG49 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fam71aB7XG49 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fam71aB7XG49 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fam71aB7XG49 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fam71aB7XG49 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fam71aB7XG49 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fam71aB7XG49 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fam71aB7XG49 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fam71aB7XG49 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Fam71aB7XG49 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.14
Fam71aB7XG49 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fam71aB7XG49 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fam71aB7XG49 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms