Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Phf11bB4XVQ1 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Phf11bB4XVQ1 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Phf11bB4XVQ1 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Phf11bB4XVQ1 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Phf11bB4XVQ1 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Phf11bB4XVQ1 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Phf11bB4XVQ1 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Phf11bB4XVQ1 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Phf11bB4XVQ1 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Phf11bB4XVQ1 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Phf11bB4XVQ1 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Phf11bB4XVQ1 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Phf11bB4XVQ1 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Phf11bB4XVQ1 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Phf11bB4XVQ1 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Phf11bB4XVQ1 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Phf11bB4XVQ1 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Phf11bB4XVQ1 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Phf11bB4XVQ1 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Phf11bB4XVQ1 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Phf11bB4XVQ1 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Phf11bB4XVQ1 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Phf11bB4XVQ1 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Phf11bB4XVQ1 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Phf11bB4XVQ1 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Phf11bB4XVQ1 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Phf11bB4XVQ1 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Phf11bB4XVQ1 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Phf11bB4XVQ1 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Phf11bB4XVQ1 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Phf11bB4XVQ1 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Phf11bB4XVQ1 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Phf11bB4XVQ1 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Phf11bB4XVQ1 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Phf11bB4XVQ1 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Phf11bB4XVQ1 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Phf11bB4XVQ1 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Phf11bB4XVQ1 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Phf11bB4XVQ1 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Phf11bB4XVQ1 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Phf11bB4XVQ1 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Phf11bB4XVQ1 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Phf11bB4XVQ1 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Phf11bB4XVQ1 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Phf11bB4XVQ1 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Phf11bB4XVQ1 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Phf11bB4XVQ1 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Phf11bB4XVQ1 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Phf11bB4XVQ1 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Phf11bB4XVQ1 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Phf11bB4XVQ1 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Phf11bB4XVQ1 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Phf11bB4XVQ1 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Phf11bB4XVQ1 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Phf11bB4XVQ1 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Phf11bB4XVQ1 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Phf11bB4XVQ1 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Phf11bB4XVQ1 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Phf11bB4XVQ1 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Phf11bB4XVQ1 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Phf11bB4XVQ1 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Phf11bB4XVQ1 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Phf11bB4XVQ1 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Phf11bB4XVQ1 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Phf11bB4XVQ1 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Phf11bB4XVQ1 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Phf11bB4XVQ1 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Phf11bB4XVQ1 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Phf11bB4XVQ1 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Phf11bB4XVQ1 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Phf11bB4XVQ1 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Phf11bB4XVQ1 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Phf11bB4XVQ1 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Phf11bB4XVQ1 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Phf11bB4XVQ1 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Phf11bB4XVQ1 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Phf11bB4XVQ1 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Phf11bB4XVQ1 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Phf11bB4XVQ1 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Phf11bB4XVQ1 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Phf11bB4XVQ1 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Phf11bB4XVQ1 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Phf11bB4XVQ1 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Phf11bB4XVQ1 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Phf11bB4XVQ1 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Phf11bB4XVQ1 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Phf11bB4XVQ1 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Phf11bB4XVQ1 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Phf11bB4XVQ1 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Phf11bB4XVQ1 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Phf11bB4XVQ1 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Phf11bB4XVQ1 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Phf11bB4XVQ1 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Phf11bB4XVQ1 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Phf11bB4XVQ1 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Phf11bB4XVQ1 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Phf11bB4XVQ1 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Phf11bB4XVQ1 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Phf11bB4XVQ1 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms