Protein–RNA interactions for Protein: B2RXZ1

Pnldc1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnldc1B2RXZ1 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pnldc1B2RXZ1 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pnldc1B2RXZ1 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pnldc1B2RXZ1 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pnldc1B2RXZ1 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pnldc1B2RXZ1 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pnldc1B2RXZ1 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pnldc1B2RXZ1 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pnldc1B2RXZ1 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pnldc1B2RXZ1 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pnldc1B2RXZ1 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pnldc1B2RXZ1 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pnldc1B2RXZ1 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pnldc1B2RXZ1 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pnldc1B2RXZ1 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pnldc1B2RXZ1 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pnldc1B2RXZ1 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pnldc1B2RXZ1 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pnldc1B2RXZ1 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pnldc1B2RXZ1 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pnldc1B2RXZ1 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pnldc1B2RXZ1 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pnldc1B2RXZ1 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pnldc1B2RXZ1 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pnldc1B2RXZ1 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pnldc1B2RXZ1 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pnldc1B2RXZ1 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pnldc1B2RXZ1 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pnldc1B2RXZ1 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pnldc1B2RXZ1 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pnldc1B2RXZ1 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pnldc1B2RXZ1 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pnldc1B2RXZ1 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pnldc1B2RXZ1 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pnldc1B2RXZ1 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pnldc1B2RXZ1 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pnldc1B2RXZ1 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pnldc1B2RXZ1 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pnldc1B2RXZ1 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pnldc1B2RXZ1 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pnldc1B2RXZ1 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pnldc1B2RXZ1 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pnldc1B2RXZ1 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pnldc1B2RXZ1 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pnldc1B2RXZ1 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pnldc1B2RXZ1 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pnldc1B2RXZ1 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pnldc1B2RXZ1 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pnldc1B2RXZ1 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pnldc1B2RXZ1 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pnldc1B2RXZ1 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pnldc1B2RXZ1 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pnldc1B2RXZ1 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pnldc1B2RXZ1 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pnldc1B2RXZ1 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pnldc1B2RXZ1 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pnldc1B2RXZ1 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pnldc1B2RXZ1 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pnldc1B2RXZ1 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pnldc1B2RXZ1 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pnldc1B2RXZ1 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pnldc1B2RXZ1 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pnldc1B2RXZ1 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pnldc1B2RXZ1 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pnldc1B2RXZ1 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pnldc1B2RXZ1 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pnldc1B2RXZ1 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pnldc1B2RXZ1 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pnldc1B2RXZ1 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pnldc1B2RXZ1 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pnldc1B2RXZ1 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pnldc1B2RXZ1 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pnldc1B2RXZ1 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pnldc1B2RXZ1 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pnldc1B2RXZ1 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pnldc1B2RXZ1 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pnldc1B2RXZ1 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pnldc1B2RXZ1 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pnldc1B2RXZ1 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pnldc1B2RXZ1 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pnldc1B2RXZ1 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pnldc1B2RXZ1 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pnldc1B2RXZ1 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pnldc1B2RXZ1 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pnldc1B2RXZ1 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pnldc1B2RXZ1 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pnldc1B2RXZ1 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pnldc1B2RXZ1 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pnldc1B2RXZ1 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pnldc1B2RXZ1 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pnldc1B2RXZ1 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pnldc1B2RXZ1 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pnldc1B2RXZ1 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pnldc1B2RXZ1 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pnldc1B2RXZ1 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pnldc1B2RXZ1 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pnldc1B2RXZ1 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pnldc1B2RXZ1 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pnldc1B2RXZ1 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pnldc1B2RXZ1 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms