Protein–RNA interactions for Protein: B2RW11

Ankrd34a, Ankyrin repeat domain 34A, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd34aB2RW11 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ankrd34aB2RW11 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ankrd34aB2RW11 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ankrd34aB2RW11 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ankrd34aB2RW11 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ankrd34aB2RW11 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ankrd34aB2RW11 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ankrd34aB2RW11 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ankrd34aB2RW11 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ankrd34aB2RW11 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ankrd34aB2RW11 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ankrd34aB2RW11 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ankrd34aB2RW11 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ankrd34aB2RW11 Gm20614-201ENSMUST00000177106 632 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ankrd34aB2RW11 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ankrd34aB2RW11 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ankrd34aB2RW11 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ankrd34aB2RW11 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ankrd34aB2RW11 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ankrd34aB2RW11 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ankrd34aB2RW11 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ankrd34aB2RW11 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ankrd34aB2RW11 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ankrd34aB2RW11 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ankrd34aB2RW11 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ankrd34aB2RW11 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ankrd34aB2RW11 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ankrd34aB2RW11 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ankrd34aB2RW11 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ankrd34aB2RW11 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ankrd34aB2RW11 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ankrd34aB2RW11 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ankrd34aB2RW11 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ankrd34aB2RW11 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ankrd34aB2RW11 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ankrd34aB2RW11 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ankrd34aB2RW11 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ankrd34aB2RW11 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ankrd34aB2RW11 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ankrd34aB2RW11 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ankrd34aB2RW11 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ankrd34aB2RW11 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ankrd34aB2RW11 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ankrd34aB2RW11 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ankrd34aB2RW11 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ankrd34aB2RW11 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ankrd34aB2RW11 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ankrd34aB2RW11 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ankrd34aB2RW11 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ankrd34aB2RW11 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ankrd34aB2RW11 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ankrd34aB2RW11 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ankrd34aB2RW11 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ankrd34aB2RW11 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ankrd34aB2RW11 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ankrd34aB2RW11 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ankrd34aB2RW11 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ankrd34aB2RW11 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ankrd34aB2RW11 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ankrd34aB2RW11 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ankrd34aB2RW11 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ankrd34aB2RW11 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ankrd34aB2RW11 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ankrd34aB2RW11 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ankrd34aB2RW11 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ankrd34aB2RW11 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ankrd34aB2RW11 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ankrd34aB2RW11 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ankrd34aB2RW11 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ankrd34aB2RW11 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ankrd34aB2RW11 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ankrd34aB2RW11 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ankrd34aB2RW11 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ankrd34aB2RW11 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ankrd34aB2RW11 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ankrd34aB2RW11 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ankrd34aB2RW11 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ankrd34aB2RW11 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ankrd34aB2RW11 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ankrd34aB2RW11 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ankrd34aB2RW11 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ankrd34aB2RW11 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ankrd34aB2RW11 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ankrd34aB2RW11 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ankrd34aB2RW11 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ankrd34aB2RW11 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ankrd34aB2RW11 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ankrd34aB2RW11 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ankrd34aB2RW11 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ankrd34aB2RW11 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ankrd34aB2RW11 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ankrd34aB2RW11 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ankrd34aB2RW11 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ankrd34aB2RW11 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ankrd34aB2RW11 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ankrd34aB2RW11 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ankrd34aB2RW11 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ankrd34aB2RW11 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ankrd34aB2RW11 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ankrd34aB2RW11 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms