Protein–RNA interactions for Protein: B2RUS7

Abcc8, ATP-binding cassette, sub-family C (CFTR/MRP), member 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc8B2RUS7 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
Abcc8B2RUS7 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Abcc8B2RUS7 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
Abcc8B2RUS7 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Abcc8B2RUS7 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Abcc8B2RUS7 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Abcc8B2RUS7 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Abcc8B2RUS7 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Abcc8B2RUS7 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Abcc8B2RUS7 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Abcc8B2RUS7 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Abcc8B2RUS7 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Abcc8B2RUS7 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Abcc8B2RUS7 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Abcc8B2RUS7 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Abcc8B2RUS7 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Abcc8B2RUS7 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Abcc8B2RUS7 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Abcc8B2RUS7 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Abcc8B2RUS7 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Abcc8B2RUS7 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Abcc8B2RUS7 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Abcc8B2RUS7 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
Abcc8B2RUS7 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Abcc8B2RUS7 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Abcc8B2RUS7 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Abcc8B2RUS7 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Abcc8B2RUS7 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Abcc8B2RUS7 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Abcc8B2RUS7 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Abcc8B2RUS7 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Abcc8B2RUS7 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Abcc8B2RUS7 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Abcc8B2RUS7 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Abcc8B2RUS7 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
Abcc8B2RUS7 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Abcc8B2RUS7 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Abcc8B2RUS7 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Abcc8B2RUS7 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Abcc8B2RUS7 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Abcc8B2RUS7 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.33
Abcc8B2RUS7 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC29.64■■■□□ 2.33
Abcc8B2RUS7 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.33
Abcc8B2RUS7 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
Abcc8B2RUS7 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
Abcc8B2RUS7 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.33
Abcc8B2RUS7 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC29.64■■■□□ 2.33
Abcc8B2RUS7 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.33
Abcc8B2RUS7 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.33
Abcc8B2RUS7 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.33
Abcc8B2RUS7 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
Abcc8B2RUS7 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
Abcc8B2RUS7 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
Abcc8B2RUS7 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
Abcc8B2RUS7 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Abcc8B2RUS7 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Abcc8B2RUS7 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
Abcc8B2RUS7 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Abcc8B2RUS7 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Abcc8B2RUS7 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Abcc8B2RUS7 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Abcc8B2RUS7 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Abcc8B2RUS7 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Abcc8B2RUS7 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Abcc8B2RUS7 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Abcc8B2RUS7 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Abcc8B2RUS7 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Abcc8B2RUS7 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Abcc8B2RUS7 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Abcc8B2RUS7 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Abcc8B2RUS7 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Abcc8B2RUS7 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
Abcc8B2RUS7 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Abcc8B2RUS7 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
Abcc8B2RUS7 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Abcc8B2RUS7 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Abcc8B2RUS7 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Abcc8B2RUS7 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Abcc8B2RUS7 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Abcc8B2RUS7 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Abcc8B2RUS7 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Abcc8B2RUS7 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
Abcc8B2RUS7 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Abcc8B2RUS7 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Abcc8B2RUS7 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Abcc8B2RUS7 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Abcc8B2RUS7 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Abcc8B2RUS7 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Abcc8B2RUS7 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Abcc8B2RUS7 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Abcc8B2RUS7 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Abcc8B2RUS7 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Abcc8B2RUS7 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Abcc8B2RUS7 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Abcc8B2RUS7 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Abcc8B2RUS7 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Abcc8B2RUS7 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Abcc8B2RUS7 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Abcc8B2RUS7 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Abcc8B2RUS7 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms