Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Usf3B2RUQ2 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Usf3B2RUQ2 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Usf3B2RUQ2 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Usf3B2RUQ2 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Usf3B2RUQ2 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Usf3B2RUQ2 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Usf3B2RUQ2 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Usf3B2RUQ2 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Usf3B2RUQ2 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Usf3B2RUQ2 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Usf3B2RUQ2 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Usf3B2RUQ2 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Usf3B2RUQ2 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Usf3B2RUQ2 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Usf3B2RUQ2 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Usf3B2RUQ2 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Usf3B2RUQ2 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Usf3B2RUQ2 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Usf3B2RUQ2 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Usf3B2RUQ2 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Usf3B2RUQ2 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Usf3B2RUQ2 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Usf3B2RUQ2 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Usf3B2RUQ2 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Usf3B2RUQ2 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Usf3B2RUQ2 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Usf3B2RUQ2 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Usf3B2RUQ2 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Usf3B2RUQ2 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Usf3B2RUQ2 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Usf3B2RUQ2 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Usf3B2RUQ2 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Usf3B2RUQ2 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Usf3B2RUQ2 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Usf3B2RUQ2 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Usf3B2RUQ2 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Usf3B2RUQ2 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Usf3B2RUQ2 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Usf3B2RUQ2 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Usf3B2RUQ2 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Usf3B2RUQ2 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Usf3B2RUQ2 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Usf3B2RUQ2 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Usf3B2RUQ2 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Usf3B2RUQ2 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Usf3B2RUQ2 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Usf3B2RUQ2 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Usf3B2RUQ2 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Usf3B2RUQ2 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Usf3B2RUQ2 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Usf3B2RUQ2 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Usf3B2RUQ2 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Usf3B2RUQ2 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Usf3B2RUQ2 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Usf3B2RUQ2 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Usf3B2RUQ2 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Usf3B2RUQ2 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Usf3B2RUQ2 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Usf3B2RUQ2 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Usf3B2RUQ2 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Usf3B2RUQ2 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Usf3B2RUQ2 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Usf3B2RUQ2 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Usf3B2RUQ2 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Usf3B2RUQ2 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
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Usf3B2RUQ2 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
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Usf3B2RUQ2 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Usf3B2RUQ2 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Usf3B2RUQ2 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
Usf3B2RUQ2 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Usf3B2RUQ2 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Usf3B2RUQ2 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Usf3B2RUQ2 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Usf3B2RUQ2 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Usf3B2RUQ2 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Usf3B2RUQ2 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Usf3B2RUQ2 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Usf3B2RUQ2 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Usf3B2RUQ2 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Usf3B2RUQ2 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Usf3B2RUQ2 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Usf3B2RUQ2 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Usf3B2RUQ2 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Usf3B2RUQ2 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Usf3B2RUQ2 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Usf3B2RUQ2 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Usf3B2RUQ2 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Usf3B2RUQ2 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Usf3B2RUQ2 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Usf3B2RUQ2 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Usf3B2RUQ2 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Usf3B2RUQ2 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Usf3B2RUQ2 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms