Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rrn3B2RS91 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rrn3B2RS91 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rrn3B2RS91 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rrn3B2RS91 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rrn3B2RS91 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rrn3B2RS91 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rrn3B2RS91 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rrn3B2RS91 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rrn3B2RS91 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rrn3B2RS91 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rrn3B2RS91 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rrn3B2RS91 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rrn3B2RS91 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rrn3B2RS91 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rrn3B2RS91 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rrn3B2RS91 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rrn3B2RS91 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rrn3B2RS91 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rrn3B2RS91 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rrn3B2RS91 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rrn3B2RS91 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rrn3B2RS91 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rrn3B2RS91 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rrn3B2RS91 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rrn3B2RS91 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rrn3B2RS91 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rrn3B2RS91 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rrn3B2RS91 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rrn3B2RS91 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rrn3B2RS91 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rrn3B2RS91 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rrn3B2RS91 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rrn3B2RS91 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rrn3B2RS91 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rrn3B2RS91 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rrn3B2RS91 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rrn3B2RS91 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rrn3B2RS91 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rrn3B2RS91 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rrn3B2RS91 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rrn3B2RS91 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rrn3B2RS91 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rrn3B2RS91 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rrn3B2RS91 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rrn3B2RS91 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rrn3B2RS91 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rrn3B2RS91 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rrn3B2RS91 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rrn3B2RS91 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rrn3B2RS91 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rrn3B2RS91 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rrn3B2RS91 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rrn3B2RS91 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rrn3B2RS91 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rrn3B2RS91 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rrn3B2RS91 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rrn3B2RS91 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rrn3B2RS91 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rrn3B2RS91 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rrn3B2RS91 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rrn3B2RS91 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rrn3B2RS91 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rrn3B2RS91 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rrn3B2RS91 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rrn3B2RS91 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rrn3B2RS91 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rrn3B2RS91 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rrn3B2RS91 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rrn3B2RS91 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rrn3B2RS91 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rrn3B2RS91 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rrn3B2RS91 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rrn3B2RS91 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rrn3B2RS91 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rrn3B2RS91 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rrn3B2RS91 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rrn3B2RS91 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rrn3B2RS91 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rrn3B2RS91 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rrn3B2RS91 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rrn3B2RS91 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rrn3B2RS91 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rrn3B2RS91 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rrn3B2RS91 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rrn3B2RS91 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rrn3B2RS91 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rrn3B2RS91 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rrn3B2RS91 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rrn3B2RS91 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rrn3B2RS91 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rrn3B2RS91 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rrn3B2RS91 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rrn3B2RS91 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rrn3B2RS91 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rrn3B2RS91 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rrn3B2RS91 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rrn3B2RS91 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rrn3B2RS91 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rrn3B2RS91 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms