Protein–RNA interactions for Protein: B2RR83

Ythdc2, Probable ATP-dependent RNA helicase YTHDC2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ythdc2B2RR83 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ythdc2B2RR83 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ythdc2B2RR83 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ythdc2B2RR83 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ythdc2B2RR83 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ythdc2B2RR83 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ythdc2B2RR83 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ythdc2B2RR83 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ythdc2B2RR83 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ythdc2B2RR83 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ythdc2B2RR83 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ythdc2B2RR83 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ythdc2B2RR83 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ythdc2B2RR83 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ythdc2B2RR83 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ythdc2B2RR83 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ythdc2B2RR83 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ythdc2B2RR83 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ythdc2B2RR83 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ythdc2B2RR83 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ythdc2B2RR83 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ythdc2B2RR83 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ythdc2B2RR83 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ythdc2B2RR83 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ythdc2B2RR83 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ythdc2B2RR83 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ythdc2B2RR83 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ythdc2B2RR83 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ythdc2B2RR83 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ythdc2B2RR83 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ythdc2B2RR83 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ythdc2B2RR83 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ythdc2B2RR83 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ythdc2B2RR83 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ythdc2B2RR83 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ythdc2B2RR83 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ythdc2B2RR83 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ythdc2B2RR83 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ythdc2B2RR83 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ythdc2B2RR83 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ythdc2B2RR83 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ythdc2B2RR83 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ythdc2B2RR83 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ythdc2B2RR83 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ythdc2B2RR83 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ythdc2B2RR83 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Ythdc2B2RR83 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ythdc2B2RR83 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ythdc2B2RR83 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Ythdc2B2RR83 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ythdc2B2RR83 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ythdc2B2RR83 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ythdc2B2RR83 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ythdc2B2RR83 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ythdc2B2RR83 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ythdc2B2RR83 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ythdc2B2RR83 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Ythdc2B2RR83 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Ythdc2B2RR83 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ythdc2B2RR83 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ythdc2B2RR83 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ythdc2B2RR83 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ythdc2B2RR83 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ythdc2B2RR83 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ythdc2B2RR83 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ythdc2B2RR83 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ythdc2B2RR83 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ythdc2B2RR83 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ythdc2B2RR83 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ythdc2B2RR83 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ythdc2B2RR83 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ythdc2B2RR83 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ythdc2B2RR83 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ythdc2B2RR83 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ythdc2B2RR83 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ythdc2B2RR83 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ythdc2B2RR83 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ythdc2B2RR83 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ythdc2B2RR83 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ythdc2B2RR83 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ythdc2B2RR83 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ythdc2B2RR83 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ythdc2B2RR83 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ythdc2B2RR83 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ythdc2B2RR83 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ythdc2B2RR83 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ythdc2B2RR83 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ythdc2B2RR83 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ythdc2B2RR83 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Ythdc2B2RR83 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ythdc2B2RR83 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ythdc2B2RR83 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ythdc2B2RR83 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ythdc2B2RR83 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ythdc2B2RR83 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Ythdc2B2RR83 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ythdc2B2RR83 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ythdc2B2RR83 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ythdc2B2RR83 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ythdc2B2RR83 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms