Protein–RNA interactions for Protein: B2KF50

Uhrf1bp1, UHRF1 (ICBP90)-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1B2KF50 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Uhrf1bp1B2KF50 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Uhrf1bp1B2KF50 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Uhrf1bp1B2KF50 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Uhrf1bp1B2KF50 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Uhrf1bp1B2KF50 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Uhrf1bp1B2KF50 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Uhrf1bp1B2KF50 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Uhrf1bp1B2KF50 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Uhrf1bp1B2KF50 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Uhrf1bp1B2KF50 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Uhrf1bp1B2KF50 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Uhrf1bp1B2KF50 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Uhrf1bp1B2KF50 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Uhrf1bp1B2KF50 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Uhrf1bp1B2KF50 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Uhrf1bp1B2KF50 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Uhrf1bp1B2KF50 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Uhrf1bp1B2KF50 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Uhrf1bp1B2KF50 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Uhrf1bp1B2KF50 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Uhrf1bp1B2KF50 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Uhrf1bp1B2KF50 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Uhrf1bp1B2KF50 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Uhrf1bp1B2KF50 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Uhrf1bp1B2KF50 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Uhrf1bp1B2KF50 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Uhrf1bp1B2KF50 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Uhrf1bp1B2KF50 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Uhrf1bp1B2KF50 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Uhrf1bp1B2KF50 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Uhrf1bp1B2KF50 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Uhrf1bp1B2KF50 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Uhrf1bp1B2KF50 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Uhrf1bp1B2KF50 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Uhrf1bp1B2KF50 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Uhrf1bp1B2KF50 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Uhrf1bp1B2KF50 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Uhrf1bp1B2KF50 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Uhrf1bp1B2KF50 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Uhrf1bp1B2KF50 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Uhrf1bp1B2KF50 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Uhrf1bp1B2KF50 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Uhrf1bp1B2KF50 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Uhrf1bp1B2KF50 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Uhrf1bp1B2KF50 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Uhrf1bp1B2KF50 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Uhrf1bp1B2KF50 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Uhrf1bp1B2KF50 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Uhrf1bp1B2KF50 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Uhrf1bp1B2KF50 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Uhrf1bp1B2KF50 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Uhrf1bp1B2KF50 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Uhrf1bp1B2KF50 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Uhrf1bp1B2KF50 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Uhrf1bp1B2KF50 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Uhrf1bp1B2KF50 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Uhrf1bp1B2KF50 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Uhrf1bp1B2KF50 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Uhrf1bp1B2KF50 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Uhrf1bp1B2KF50 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Uhrf1bp1B2KF50 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Uhrf1bp1B2KF50 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Uhrf1bp1B2KF50 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Uhrf1bp1B2KF50 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Uhrf1bp1B2KF50 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Uhrf1bp1B2KF50 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Uhrf1bp1B2KF50 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Uhrf1bp1B2KF50 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Uhrf1bp1B2KF50 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Uhrf1bp1B2KF50 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Uhrf1bp1B2KF50 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Uhrf1bp1B2KF50 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Uhrf1bp1B2KF50 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Uhrf1bp1B2KF50 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Uhrf1bp1B2KF50 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Uhrf1bp1B2KF50 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Uhrf1bp1B2KF50 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Uhrf1bp1B2KF50 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Uhrf1bp1B2KF50 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Uhrf1bp1B2KF50 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Uhrf1bp1B2KF50 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Uhrf1bp1B2KF50 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Uhrf1bp1B2KF50 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Uhrf1bp1B2KF50 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Uhrf1bp1B2KF50 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Uhrf1bp1B2KF50 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Uhrf1bp1B2KF50 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Uhrf1bp1B2KF50 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Uhrf1bp1B2KF50 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Uhrf1bp1B2KF50 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Uhrf1bp1B2KF50 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Uhrf1bp1B2KF50 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Uhrf1bp1B2KF50 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Uhrf1bp1B2KF50 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Uhrf1bp1B2KF50 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Uhrf1bp1B2KF50 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Uhrf1bp1B2KF50 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms