Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ07

Tubb1, Tubulin beta-1 chain, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb1A2AQ07 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubb1A2AQ07 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubb1A2AQ07 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubb1A2AQ07 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubb1A2AQ07 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubb1A2AQ07 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubb1A2AQ07 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubb1A2AQ07 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubb1A2AQ07 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubb1A2AQ07 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubb1A2AQ07 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubb1A2AQ07 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubb1A2AQ07 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubb1A2AQ07 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubb1A2AQ07 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubb1A2AQ07 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubb1A2AQ07 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubb1A2AQ07 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubb1A2AQ07 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubb1A2AQ07 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubb1A2AQ07 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubb1A2AQ07 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubb1A2AQ07 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubb1A2AQ07 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubb1A2AQ07 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubb1A2AQ07 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubb1A2AQ07 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubb1A2AQ07 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubb1A2AQ07 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubb1A2AQ07 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubb1A2AQ07 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubb1A2AQ07 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubb1A2AQ07 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubb1A2AQ07 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubb1A2AQ07 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubb1A2AQ07 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubb1A2AQ07 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubb1A2AQ07 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubb1A2AQ07 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubb1A2AQ07 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubb1A2AQ07 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubb1A2AQ07 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubb1A2AQ07 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubb1A2AQ07 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubb1A2AQ07 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubb1A2AQ07 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubb1A2AQ07 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubb1A2AQ07 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubb1A2AQ07 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubb1A2AQ07 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubb1A2AQ07 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubb1A2AQ07 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubb1A2AQ07 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubb1A2AQ07 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubb1A2AQ07 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubb1A2AQ07 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubb1A2AQ07 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubb1A2AQ07 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubb1A2AQ07 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubb1A2AQ07 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubb1A2AQ07 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubb1A2AQ07 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubb1A2AQ07 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubb1A2AQ07 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubb1A2AQ07 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubb1A2AQ07 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubb1A2AQ07 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubb1A2AQ07 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubb1A2AQ07 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubb1A2AQ07 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubb1A2AQ07 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubb1A2AQ07 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubb1A2AQ07 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubb1A2AQ07 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubb1A2AQ07 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubb1A2AQ07 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubb1A2AQ07 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubb1A2AQ07 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubb1A2AQ07 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubb1A2AQ07 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubb1A2AQ07 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubb1A2AQ07 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubb1A2AQ07 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubb1A2AQ07 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubb1A2AQ07 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubb1A2AQ07 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubb1A2AQ07 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubb1A2AQ07 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubb1A2AQ07 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubb1A2AQ07 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubb1A2AQ07 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubb1A2AQ07 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubb1A2AQ07 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubb1A2AQ07 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubb1A2AQ07 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubb1A2AQ07 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubb1A2AQ07 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubb1A2AQ07 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubb1A2AQ07 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubb1A2AQ07 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms