Protein–RNA interactions for Protein: A2AH22

Ambra1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ambra1A2AH22 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ambra1A2AH22 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ambra1A2AH22 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ambra1A2AH22 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ambra1A2AH22 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ambra1A2AH22 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ambra1A2AH22 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ambra1A2AH22 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ambra1A2AH22 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ambra1A2AH22 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ambra1A2AH22 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ambra1A2AH22 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ambra1A2AH22 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ambra1A2AH22 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ambra1A2AH22 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ambra1A2AH22 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ambra1A2AH22 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ambra1A2AH22 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ambra1A2AH22 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ambra1A2AH22 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ambra1A2AH22 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ambra1A2AH22 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ambra1A2AH22 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ambra1A2AH22 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ambra1A2AH22 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ambra1A2AH22 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ambra1A2AH22 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ambra1A2AH22 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ambra1A2AH22 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ambra1A2AH22 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ambra1A2AH22 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ambra1A2AH22 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ambra1A2AH22 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ambra1A2AH22 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ambra1A2AH22 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ambra1A2AH22 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ambra1A2AH22 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ambra1A2AH22 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ambra1A2AH22 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ambra1A2AH22 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ambra1A2AH22 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ambra1A2AH22 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ambra1A2AH22 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ambra1A2AH22 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ambra1A2AH22 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ambra1A2AH22 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ambra1A2AH22 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ambra1A2AH22 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ambra1A2AH22 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ambra1A2AH22 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ambra1A2AH22 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ambra1A2AH22 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ambra1A2AH22 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ambra1A2AH22 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ambra1A2AH22 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ambra1A2AH22 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ambra1A2AH22 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ambra1A2AH22 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ambra1A2AH22 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ambra1A2AH22 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ambra1A2AH22 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ambra1A2AH22 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ambra1A2AH22 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ambra1A2AH22 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ambra1A2AH22 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ambra1A2AH22 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ambra1A2AH22 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ambra1A2AH22 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ambra1A2AH22 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ambra1A2AH22 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ambra1A2AH22 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ambra1A2AH22 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ambra1A2AH22 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ambra1A2AH22 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ambra1A2AH22 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ambra1A2AH22 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ambra1A2AH22 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ambra1A2AH22 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ambra1A2AH22 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ambra1A2AH22 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ambra1A2AH22 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ambra1A2AH22 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ambra1A2AH22 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ambra1A2AH22 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ambra1A2AH22 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ambra1A2AH22 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ambra1A2AH22 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ambra1A2AH22 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ambra1A2AH22 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ambra1A2AH22 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ambra1A2AH22 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ambra1A2AH22 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ambra1A2AH22 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ambra1A2AH22 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ambra1A2AH22 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ambra1A2AH22 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ambra1A2AH22 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ambra1A2AH22 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ambra1A2AH22 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ambra1A2AH22 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms