Protein–RNA interactions for Protein: A2A935

Prdm16, PR domain zinc finger protein 16, mousemouse

Predictions only

Length 1,275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm16A2A935 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prdm16A2A935 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prdm16A2A935 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Prdm16A2A935 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prdm16A2A935 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prdm16A2A935 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prdm16A2A935 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prdm16A2A935 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prdm16A2A935 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prdm16A2A935 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prdm16A2A935 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prdm16A2A935 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prdm16A2A935 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prdm16A2A935 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prdm16A2A935 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prdm16A2A935 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prdm16A2A935 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prdm16A2A935 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prdm16A2A935 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prdm16A2A935 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prdm16A2A935 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prdm16A2A935 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prdm16A2A935 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prdm16A2A935 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prdm16A2A935 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Prdm16A2A935 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Prdm16A2A935 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Prdm16A2A935 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Prdm16A2A935 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Prdm16A2A935 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Prdm16A2A935 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Prdm16A2A935 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Prdm16A2A935 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Prdm16A2A935 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Prdm16A2A935 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Prdm16A2A935 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Prdm16A2A935 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Prdm16A2A935 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Prdm16A2A935 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Prdm16A2A935 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Prdm16A2A935 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Prdm16A2A935 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prdm16A2A935 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prdm16A2A935 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prdm16A2A935 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prdm16A2A935 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prdm16A2A935 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prdm16A2A935 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prdm16A2A935 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prdm16A2A935 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prdm16A2A935 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prdm16A2A935 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prdm16A2A935 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prdm16A2A935 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prdm16A2A935 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prdm16A2A935 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prdm16A2A935 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prdm16A2A935 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prdm16A2A935 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prdm16A2A935 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prdm16A2A935 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prdm16A2A935 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Prdm16A2A935 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prdm16A2A935 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prdm16A2A935 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prdm16A2A935 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Prdm16A2A935 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prdm16A2A935 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prdm16A2A935 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prdm16A2A935 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prdm16A2A935 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prdm16A2A935 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prdm16A2A935 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prdm16A2A935 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prdm16A2A935 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prdm16A2A935 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prdm16A2A935 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prdm16A2A935 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prdm16A2A935 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prdm16A2A935 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prdm16A2A935 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prdm16A2A935 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prdm16A2A935 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Prdm16A2A935 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Prdm16A2A935 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prdm16A2A935 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prdm16A2A935 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prdm16A2A935 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prdm16A2A935 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prdm16A2A935 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prdm16A2A935 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prdm16A2A935 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prdm16A2A935 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prdm16A2A935 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prdm16A2A935 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prdm16A2A935 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prdm16A2A935 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Prdm16A2A935 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Prdm16A2A935 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prdm16A2A935 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms