Protein–RNA interactions for Protein: A0N8N6

Trav12-2, T cell receptor alpha variable 12-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav12-2A0N8N6 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Trav12-2A0N8N6 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Trav12-2A0N8N6 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Trav12-2A0N8N6 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Trav12-2A0N8N6 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Trav12-2A0N8N6 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Trav12-2A0N8N6 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trav12-2A0N8N6 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trav12-2A0N8N6 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trav12-2A0N8N6 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trav12-2A0N8N6 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Trav12-2A0N8N6 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Trav12-2A0N8N6 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trav12-2A0N8N6 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trav12-2A0N8N6 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trav12-2A0N8N6 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Trav12-2A0N8N6 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trav12-2A0N8N6 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trav12-2A0N8N6 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trav12-2A0N8N6 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trav12-2A0N8N6 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Trav12-2A0N8N6 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trav12-2A0N8N6 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trav12-2A0N8N6 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trav12-2A0N8N6 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trav12-2A0N8N6 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trav12-2A0N8N6 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trav12-2A0N8N6 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trav12-2A0N8N6 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trav12-2A0N8N6 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trav12-2A0N8N6 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trav12-2A0N8N6 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Trav12-2A0N8N6 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trav12-2A0N8N6 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trav12-2A0N8N6 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trav12-2A0N8N6 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trav12-2A0N8N6 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trav12-2A0N8N6 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trav12-2A0N8N6 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trav12-2A0N8N6 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trav12-2A0N8N6 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trav12-2A0N8N6 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trav12-2A0N8N6 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trav12-2A0N8N6 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trav12-2A0N8N6 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trav12-2A0N8N6 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Trav12-2A0N8N6 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trav12-2A0N8N6 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trav12-2A0N8N6 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trav12-2A0N8N6 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trav12-2A0N8N6 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Trav12-2A0N8N6 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trav12-2A0N8N6 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trav12-2A0N8N6 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trav12-2A0N8N6 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Trav12-2A0N8N6 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Trav12-2A0N8N6 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trav12-2A0N8N6 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trav12-2A0N8N6 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trav12-2A0N8N6 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trav12-2A0N8N6 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trav12-2A0N8N6 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trav12-2A0N8N6 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trav12-2A0N8N6 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trav12-2A0N8N6 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trav12-2A0N8N6 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trav12-2A0N8N6 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trav12-2A0N8N6 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trav12-2A0N8N6 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trav12-2A0N8N6 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trav12-2A0N8N6 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trav12-2A0N8N6 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trav12-2A0N8N6 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trav12-2A0N8N6 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trav12-2A0N8N6 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trav12-2A0N8N6 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trav12-2A0N8N6 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trav12-2A0N8N6 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trav12-2A0N8N6 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trav12-2A0N8N6 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trav12-2A0N8N6 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trav12-2A0N8N6 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trav12-2A0N8N6 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Trav12-2A0N8N6 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trav12-2A0N8N6 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trav12-2A0N8N6 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trav12-2A0N8N6 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trav12-2A0N8N6 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trav12-2A0N8N6 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trav12-2A0N8N6 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trav12-2A0N8N6 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trav12-2A0N8N6 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trav12-2A0N8N6 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trav12-2A0N8N6 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trav12-2A0N8N6 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trav12-2A0N8N6 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trav12-2A0N8N6 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trav12-2A0N8N6 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trav12-2A0N8N6 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trav12-2A0N8N6 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60 ms