Protein–RNA interactions for Protein: W8DXL4

Lrit3, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 681 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit3W8DXL4 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Lrit3W8DXL4 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Lrit3W8DXL4 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Lrit3W8DXL4 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Lrit3W8DXL4 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Lrit3W8DXL4 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Lrit3W8DXL4 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.15
Lrit3W8DXL4 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Lrit3W8DXL4 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lrit3W8DXL4 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lrit3W8DXL4 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lrit3W8DXL4 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lrit3W8DXL4 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lrit3W8DXL4 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lrit3W8DXL4 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lrit3W8DXL4 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Lrit3W8DXL4 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lrit3W8DXL4 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lrit3W8DXL4 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lrit3W8DXL4 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lrit3W8DXL4 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lrit3W8DXL4 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lrit3W8DXL4 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lrit3W8DXL4 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lrit3W8DXL4 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lrit3W8DXL4 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lrit3W8DXL4 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lrit3W8DXL4 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lrit3W8DXL4 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lrit3W8DXL4 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lrit3W8DXL4 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lrit3W8DXL4 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lrit3W8DXL4 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lrit3W8DXL4 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lrit3W8DXL4 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lrit3W8DXL4 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lrit3W8DXL4 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lrit3W8DXL4 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lrit3W8DXL4 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lrit3W8DXL4 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lrit3W8DXL4 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lrit3W8DXL4 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lrit3W8DXL4 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lrit3W8DXL4 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lrit3W8DXL4 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lrit3W8DXL4 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Lrit3W8DXL4 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lrit3W8DXL4 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lrit3W8DXL4 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lrit3W8DXL4 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lrit3W8DXL4 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lrit3W8DXL4 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lrit3W8DXL4 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lrit3W8DXL4 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lrit3W8DXL4 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lrit3W8DXL4 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lrit3W8DXL4 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lrit3W8DXL4 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lrit3W8DXL4 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lrit3W8DXL4 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lrit3W8DXL4 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lrit3W8DXL4 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lrit3W8DXL4 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lrit3W8DXL4 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lrit3W8DXL4 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lrit3W8DXL4 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lrit3W8DXL4 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lrit3W8DXL4 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lrit3W8DXL4 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lrit3W8DXL4 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lrit3W8DXL4 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lrit3W8DXL4 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lrit3W8DXL4 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lrit3W8DXL4 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lrit3W8DXL4 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lrit3W8DXL4 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Lrit3W8DXL4 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lrit3W8DXL4 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Lrit3W8DXL4 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Lrit3W8DXL4 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Lrit3W8DXL4 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Lrit3W8DXL4 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Lrit3W8DXL4 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Lrit3W8DXL4 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lrit3W8DXL4 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Lrit3W8DXL4 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lrit3W8DXL4 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lrit3W8DXL4 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lrit3W8DXL4 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lrit3W8DXL4 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lrit3W8DXL4 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lrit3W8DXL4 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lrit3W8DXL4 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lrit3W8DXL4 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lrit3W8DXL4 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lrit3W8DXL4 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lrit3W8DXL4 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Lrit3W8DXL4 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Lrit3W8DXL4 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Lrit3W8DXL4 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms