Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP1

Speer3, MCG129800, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer3W4VSP1 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Speer3W4VSP1 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Speer3W4VSP1 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Speer3W4VSP1 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Speer3W4VSP1 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Speer3W4VSP1 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Speer3W4VSP1 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Speer3W4VSP1 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Speer3W4VSP1 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Speer3W4VSP1 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Speer3W4VSP1 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Speer3W4VSP1 AC125117.2-201ENSMUST00000228344 1140 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Speer3W4VSP1 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Speer3W4VSP1 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Speer3W4VSP1 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Speer3W4VSP1 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Speer3W4VSP1 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Speer3W4VSP1 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Speer3W4VSP1 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Speer3W4VSP1 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Speer3W4VSP1 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Speer3W4VSP1 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Speer3W4VSP1 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Speer3W4VSP1 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Speer3W4VSP1 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Speer3W4VSP1 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Speer3W4VSP1 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Speer3W4VSP1 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Speer3W4VSP1 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Speer3W4VSP1 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Speer3W4VSP1 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Speer3W4VSP1 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Speer3W4VSP1 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Speer3W4VSP1 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Speer3W4VSP1 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Speer3W4VSP1 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Speer3W4VSP1 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Speer3W4VSP1 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Speer3W4VSP1 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Speer3W4VSP1 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Speer3W4VSP1 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Speer3W4VSP1 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Speer3W4VSP1 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Speer3W4VSP1 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Speer3W4VSP1 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Speer3W4VSP1 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Speer3W4VSP1 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Speer3W4VSP1 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Speer3W4VSP1 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Speer3W4VSP1 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Speer3W4VSP1 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Speer3W4VSP1 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Speer3W4VSP1 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Speer3W4VSP1 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Speer3W4VSP1 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Speer3W4VSP1 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Speer3W4VSP1 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Speer3W4VSP1 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Speer3W4VSP1 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Speer3W4VSP1 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Speer3W4VSP1 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Speer3W4VSP1 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Speer3W4VSP1 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Speer3W4VSP1 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Speer3W4VSP1 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Speer3W4VSP1 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Speer3W4VSP1 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Speer3W4VSP1 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Speer3W4VSP1 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Speer3W4VSP1 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Speer3W4VSP1 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Speer3W4VSP1 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Speer3W4VSP1 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Speer3W4VSP1 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Speer3W4VSP1 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Speer3W4VSP1 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Speer3W4VSP1 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Speer3W4VSP1 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Speer3W4VSP1 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Speer3W4VSP1 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Speer3W4VSP1 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Speer3W4VSP1 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Speer3W4VSP1 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Speer3W4VSP1 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Speer3W4VSP1 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Speer3W4VSP1 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Speer3W4VSP1 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Speer3W4VSP1 Gm43275-201ENSMUST00000202053 1020 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Speer3W4VSP1 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Speer3W4VSP1 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Speer3W4VSP1 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Speer3W4VSP1 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Speer3W4VSP1 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Speer3W4VSP1 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Speer3W4VSP1 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Speer3W4VSP1 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Speer3W4VSP1 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Speer3W4VSP1 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Speer3W4VSP1 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Speer3W4VSP1 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms