Protein–RNA interactions for Protein: V9GX38

Gm17190, Predicted gene 17190, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17190V9GX38 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Gm17190V9GX38 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Gm17190V9GX38 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm17190V9GX38 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm17190V9GX38 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm17190V9GX38 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm17190V9GX38 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm17190V9GX38 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm17190V9GX38 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm17190V9GX38 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm17190V9GX38 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm17190V9GX38 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm17190V9GX38 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm17190V9GX38 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm17190V9GX38 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm17190V9GX38 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm17190V9GX38 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm17190V9GX38 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm17190V9GX38 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm17190V9GX38 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm17190V9GX38 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm17190V9GX38 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm17190V9GX38 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm17190V9GX38 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm17190V9GX38 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm17190V9GX38 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm17190V9GX38 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm17190V9GX38 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm17190V9GX38 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm17190V9GX38 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm17190V9GX38 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm17190V9GX38 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm17190V9GX38 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm17190V9GX38 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm17190V9GX38 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm17190V9GX38 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm17190V9GX38 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm17190V9GX38 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm17190V9GX38 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm17190V9GX38 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm17190V9GX38 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm17190V9GX38 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm17190V9GX38 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm17190V9GX38 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm17190V9GX38 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm17190V9GX38 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm17190V9GX38 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm17190V9GX38 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm17190V9GX38 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm17190V9GX38 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm17190V9GX38 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm17190V9GX38 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm17190V9GX38 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm17190V9GX38 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm17190V9GX38 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm17190V9GX38 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm17190V9GX38 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm17190V9GX38 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm17190V9GX38 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm17190V9GX38 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm17190V9GX38 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm17190V9GX38 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm17190V9GX38 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm17190V9GX38 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm17190V9GX38 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm17190V9GX38 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm17190V9GX38 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm17190V9GX38 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm17190V9GX38 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm17190V9GX38 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms