Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2P8

Vamp5, Vesicle-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp5Q9Z2P8 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vamp5Q9Z2P8 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vamp5Q9Z2P8 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vamp5Q9Z2P8 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vamp5Q9Z2P8 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vamp5Q9Z2P8 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vamp5Q9Z2P8 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vamp5Q9Z2P8 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vamp5Q9Z2P8 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vamp5Q9Z2P8 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vamp5Q9Z2P8 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vamp5Q9Z2P8 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vamp5Q9Z2P8 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vamp5Q9Z2P8 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vamp5Q9Z2P8 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vamp5Q9Z2P8 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vamp5Q9Z2P8 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vamp5Q9Z2P8 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vamp5Q9Z2P8 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vamp5Q9Z2P8 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vamp5Q9Z2P8 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vamp5Q9Z2P8 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vamp5Q9Z2P8 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vamp5Q9Z2P8 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vamp5Q9Z2P8 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vamp5Q9Z2P8 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vamp5Q9Z2P8 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vamp5Q9Z2P8 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vamp5Q9Z2P8 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vamp5Q9Z2P8 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vamp5Q9Z2P8 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vamp5Q9Z2P8 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vamp5Q9Z2P8 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vamp5Q9Z2P8 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vamp5Q9Z2P8 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vamp5Q9Z2P8 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vamp5Q9Z2P8 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vamp5Q9Z2P8 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vamp5Q9Z2P8 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vamp5Q9Z2P8 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vamp5Q9Z2P8 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Vamp5Q9Z2P8 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Vamp5Q9Z2P8 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Vamp5Q9Z2P8 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vamp5Q9Z2P8 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Vamp5Q9Z2P8 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vamp5Q9Z2P8 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vamp5Q9Z2P8 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vamp5Q9Z2P8 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vamp5Q9Z2P8 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vamp5Q9Z2P8 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vamp5Q9Z2P8 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vamp5Q9Z2P8 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vamp5Q9Z2P8 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vamp5Q9Z2P8 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vamp5Q9Z2P8 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vamp5Q9Z2P8 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vamp5Q9Z2P8 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vamp5Q9Z2P8 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vamp5Q9Z2P8 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vamp5Q9Z2P8 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vamp5Q9Z2P8 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vamp5Q9Z2P8 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vamp5Q9Z2P8 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vamp5Q9Z2P8 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vamp5Q9Z2P8 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vamp5Q9Z2P8 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vamp5Q9Z2P8 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vamp5Q9Z2P8 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vamp5Q9Z2P8 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vamp5Q9Z2P8 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vamp5Q9Z2P8 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vamp5Q9Z2P8 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vamp5Q9Z2P8 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vamp5Q9Z2P8 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vamp5Q9Z2P8 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vamp5Q9Z2P8 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vamp5Q9Z2P8 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vamp5Q9Z2P8 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vamp5Q9Z2P8 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vamp5Q9Z2P8 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vamp5Q9Z2P8 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vamp5Q9Z2P8 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vamp5Q9Z2P8 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vamp5Q9Z2P8 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vamp5Q9Z2P8 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vamp5Q9Z2P8 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vamp5Q9Z2P8 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vamp5Q9Z2P8 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vamp5Q9Z2P8 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vamp5Q9Z2P8 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vamp5Q9Z2P8 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vamp5Q9Z2P8 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vamp5Q9Z2P8 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vamp5Q9Z2P8 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vamp5Q9Z2P8 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Vamp5Q9Z2P8 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Vamp5Q9Z2P8 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Vamp5Q9Z2P8 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Vamp5Q9Z2P8 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms