Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mbd3Q9Z2D8 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mbd3Q9Z2D8 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mbd3Q9Z2D8 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mbd3Q9Z2D8 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mbd3Q9Z2D8 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mbd3Q9Z2D8 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mbd3Q9Z2D8 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mbd3Q9Z2D8 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mbd3Q9Z2D8 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mbd3Q9Z2D8 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mbd3Q9Z2D8 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mbd3Q9Z2D8 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mbd3Q9Z2D8 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mbd3Q9Z2D8 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mbd3Q9Z2D8 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mbd3Q9Z2D8 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mbd3Q9Z2D8 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mbd3Q9Z2D8 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mbd3Q9Z2D8 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mbd3Q9Z2D8 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mbd3Q9Z2D8 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mbd3Q9Z2D8 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mbd3Q9Z2D8 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Mbd3Q9Z2D8 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mbd3Q9Z2D8 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mbd3Q9Z2D8 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mbd3Q9Z2D8 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mbd3Q9Z2D8 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mbd3Q9Z2D8 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mbd3Q9Z2D8 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mbd3Q9Z2D8 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mbd3Q9Z2D8 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mbd3Q9Z2D8 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Mbd3Q9Z2D8 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mbd3Q9Z2D8 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mbd3Q9Z2D8 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mbd3Q9Z2D8 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mbd3Q9Z2D8 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mbd3Q9Z2D8 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mbd3Q9Z2D8 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mbd3Q9Z2D8 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mbd3Q9Z2D8 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mbd3Q9Z2D8 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mbd3Q9Z2D8 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mbd3Q9Z2D8 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mbd3Q9Z2D8 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mbd3Q9Z2D8 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mbd3Q9Z2D8 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mbd3Q9Z2D8 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mbd3Q9Z2D8 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mbd3Q9Z2D8 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mbd3Q9Z2D8 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mbd3Q9Z2D8 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mbd3Q9Z2D8 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mbd3Q9Z2D8 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mbd3Q9Z2D8 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Mbd3Q9Z2D8 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mbd3Q9Z2D8 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mbd3Q9Z2D8 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Mbd3Q9Z2D8 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mbd3Q9Z2D8 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mbd3Q9Z2D8 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Mbd3Q9Z2D8 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mbd3Q9Z2D8 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mbd3Q9Z2D8 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mbd3Q9Z2D8 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mbd3Q9Z2D8 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mbd3Q9Z2D8 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mbd3Q9Z2D8 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mbd3Q9Z2D8 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mbd3Q9Z2D8 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mbd3Q9Z2D8 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mbd3Q9Z2D8 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mbd3Q9Z2D8 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mbd3Q9Z2D8 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mbd3Q9Z2D8 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Mbd3Q9Z2D8 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mbd3Q9Z2D8 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mbd3Q9Z2D8 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Mbd3Q9Z2D8 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mbd3Q9Z2D8 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mbd3Q9Z2D8 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mbd3Q9Z2D8 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mbd3Q9Z2D8 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mbd3Q9Z2D8 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mbd3Q9Z2D8 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mbd3Q9Z2D8 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mbd3Q9Z2D8 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mbd3Q9Z2D8 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mbd3Q9Z2D8 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mbd3Q9Z2D8 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mbd3Q9Z2D8 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mbd3Q9Z2D8 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mbd3Q9Z2D8 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mbd3Q9Z2D8 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Mbd3Q9Z2D8 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mbd3Q9Z2D8 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mbd3Q9Z2D8 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mbd3Q9Z2D8 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms