Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lgr5Q9Z1P4 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lgr5Q9Z1P4 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lgr5Q9Z1P4 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lgr5Q9Z1P4 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lgr5Q9Z1P4 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Lgr5Q9Z1P4 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lgr5Q9Z1P4 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lgr5Q9Z1P4 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lgr5Q9Z1P4 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lgr5Q9Z1P4 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lgr5Q9Z1P4 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lgr5Q9Z1P4 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lgr5Q9Z1P4 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lgr5Q9Z1P4 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lgr5Q9Z1P4 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Lgr5Q9Z1P4 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lgr5Q9Z1P4 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lgr5Q9Z1P4 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Lgr5Q9Z1P4 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Lgr5Q9Z1P4 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
Lgr5Q9Z1P4 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
Lgr5Q9Z1P4 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lgr5Q9Z1P4 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lgr5Q9Z1P4 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lgr5Q9Z1P4 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lgr5Q9Z1P4 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lgr5Q9Z1P4 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lgr5Q9Z1P4 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lgr5Q9Z1P4 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lgr5Q9Z1P4 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lgr5Q9Z1P4 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lgr5Q9Z1P4 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lgr5Q9Z1P4 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lgr5Q9Z1P4 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lgr5Q9Z1P4 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lgr5Q9Z1P4 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lgr5Q9Z1P4 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lgr5Q9Z1P4 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lgr5Q9Z1P4 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lgr5Q9Z1P4 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lgr5Q9Z1P4 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lgr5Q9Z1P4 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lgr5Q9Z1P4 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lgr5Q9Z1P4 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lgr5Q9Z1P4 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lgr5Q9Z1P4 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lgr5Q9Z1P4 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lgr5Q9Z1P4 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lgr5Q9Z1P4 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lgr5Q9Z1P4 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lgr5Q9Z1P4 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lgr5Q9Z1P4 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lgr5Q9Z1P4 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lgr5Q9Z1P4 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Lgr5Q9Z1P4 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Lgr5Q9Z1P4 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lgr5Q9Z1P4 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lgr5Q9Z1P4 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lgr5Q9Z1P4 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lgr5Q9Z1P4 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lgr5Q9Z1P4 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lgr5Q9Z1P4 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lgr5Q9Z1P4 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lgr5Q9Z1P4 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lgr5Q9Z1P4 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lgr5Q9Z1P4 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lgr5Q9Z1P4 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lgr5Q9Z1P4 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lgr5Q9Z1P4 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lgr5Q9Z1P4 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lgr5Q9Z1P4 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lgr5Q9Z1P4 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lgr5Q9Z1P4 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lgr5Q9Z1P4 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lgr5Q9Z1P4 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lgr5Q9Z1P4 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Lgr5Q9Z1P4 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Lgr5Q9Z1P4 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lgr5Q9Z1P4 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Lgr5Q9Z1P4 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lgr5Q9Z1P4 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lgr5Q9Z1P4 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Lgr5Q9Z1P4 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lgr5Q9Z1P4 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lgr5Q9Z1P4 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lgr5Q9Z1P4 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lgr5Q9Z1P4 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lgr5Q9Z1P4 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lgr5Q9Z1P4 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lgr5Q9Z1P4 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lgr5Q9Z1P4 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lgr5Q9Z1P4 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lgr5Q9Z1P4 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lgr5Q9Z1P4 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lgr5Q9Z1P4 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lgr5Q9Z1P4 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lgr5Q9Z1P4 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lgr5Q9Z1P4 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lgr5Q9Z1P4 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms