Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0E6

Gbp2, Guanylate-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp2Q9Z0E6 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gbp2Q9Z0E6 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gbp2Q9Z0E6 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gbp2Q9Z0E6 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gbp2Q9Z0E6 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gbp2Q9Z0E6 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gbp2Q9Z0E6 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gbp2Q9Z0E6 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gbp2Q9Z0E6 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gbp2Q9Z0E6 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gbp2Q9Z0E6 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gbp2Q9Z0E6 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbp2Q9Z0E6 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbp2Q9Z0E6 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbp2Q9Z0E6 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbp2Q9Z0E6 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbp2Q9Z0E6 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbp2Q9Z0E6 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbp2Q9Z0E6 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbp2Q9Z0E6 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbp2Q9Z0E6 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbp2Q9Z0E6 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbp2Q9Z0E6 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbp2Q9Z0E6 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbp2Q9Z0E6 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbp2Q9Z0E6 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbp2Q9Z0E6 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbp2Q9Z0E6 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbp2Q9Z0E6 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbp2Q9Z0E6 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbp2Q9Z0E6 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbp2Q9Z0E6 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbp2Q9Z0E6 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbp2Q9Z0E6 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbp2Q9Z0E6 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbp2Q9Z0E6 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbp2Q9Z0E6 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gbp2Q9Z0E6 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gbp2Q9Z0E6 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gbp2Q9Z0E6 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gbp2Q9Z0E6 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gbp2Q9Z0E6 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gbp2Q9Z0E6 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gbp2Q9Z0E6 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gbp2Q9Z0E6 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gbp2Q9Z0E6 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gbp2Q9Z0E6 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gbp2Q9Z0E6 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gbp2Q9Z0E6 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gbp2Q9Z0E6 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gbp2Q9Z0E6 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gbp2Q9Z0E6 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gbp2Q9Z0E6 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gbp2Q9Z0E6 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gbp2Q9Z0E6 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gbp2Q9Z0E6 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gbp2Q9Z0E6 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gbp2Q9Z0E6 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gbp2Q9Z0E6 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gbp2Q9Z0E6 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gbp2Q9Z0E6 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gbp2Q9Z0E6 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gbp2Q9Z0E6 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gbp2Q9Z0E6 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gbp2Q9Z0E6 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gbp2Q9Z0E6 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gbp2Q9Z0E6 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gbp2Q9Z0E6 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gbp2Q9Z0E6 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gbp2Q9Z0E6 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gbp2Q9Z0E6 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gbp2Q9Z0E6 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gbp2Q9Z0E6 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gbp2Q9Z0E6 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gbp2Q9Z0E6 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gbp2Q9Z0E6 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gbp2Q9Z0E6 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gbp2Q9Z0E6 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gbp2Q9Z0E6 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gbp2Q9Z0E6 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gbp2Q9Z0E6 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gbp2Q9Z0E6 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gbp2Q9Z0E6 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gbp2Q9Z0E6 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gbp2Q9Z0E6 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gbp2Q9Z0E6 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gbp2Q9Z0E6 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gbp2Q9Z0E6 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gbp2Q9Z0E6 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gbp2Q9Z0E6 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gbp2Q9Z0E6 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gbp2Q9Z0E6 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gbp2Q9Z0E6 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gbp2Q9Z0E6 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gbp2Q9Z0E6 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gbp2Q9Z0E6 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gbp2Q9Z0E6 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gbp2Q9Z0E6 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gbp2Q9Z0E6 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gbp2Q9Z0E6 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms