Protein–RNA interactions for Protein: Q9R244

Trpc2, Short transient receptor potential channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc2Q9R244 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trpc2Q9R244 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trpc2Q9R244 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trpc2Q9R244 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trpc2Q9R244 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Trpc2Q9R244 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trpc2Q9R244 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trpc2Q9R244 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trpc2Q9R244 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trpc2Q9R244 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trpc2Q9R244 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trpc2Q9R244 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trpc2Q9R244 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trpc2Q9R244 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trpc2Q9R244 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trpc2Q9R244 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trpc2Q9R244 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trpc2Q9R244 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trpc2Q9R244 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trpc2Q9R244 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trpc2Q9R244 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trpc2Q9R244 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Trpc2Q9R244 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Trpc2Q9R244 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trpc2Q9R244 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trpc2Q9R244 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trpc2Q9R244 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trpc2Q9R244 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trpc2Q9R244 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trpc2Q9R244 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trpc2Q9R244 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trpc2Q9R244 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trpc2Q9R244 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trpc2Q9R244 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trpc2Q9R244 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trpc2Q9R244 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trpc2Q9R244 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trpc2Q9R244 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trpc2Q9R244 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trpc2Q9R244 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trpc2Q9R244 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trpc2Q9R244 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trpc2Q9R244 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trpc2Q9R244 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trpc2Q9R244 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trpc2Q9R244 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trpc2Q9R244 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trpc2Q9R244 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trpc2Q9R244 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trpc2Q9R244 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trpc2Q9R244 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trpc2Q9R244 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trpc2Q9R244 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trpc2Q9R244 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trpc2Q9R244 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trpc2Q9R244 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trpc2Q9R244 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trpc2Q9R244 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trpc2Q9R244 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trpc2Q9R244 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trpc2Q9R244 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trpc2Q9R244 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trpc2Q9R244 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trpc2Q9R244 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trpc2Q9R244 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trpc2Q9R244 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trpc2Q9R244 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Trpc2Q9R244 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trpc2Q9R244 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trpc2Q9R244 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Trpc2Q9R244 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trpc2Q9R244 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trpc2Q9R244 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trpc2Q9R244 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trpc2Q9R244 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trpc2Q9R244 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trpc2Q9R244 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Trpc2Q9R244 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trpc2Q9R244 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trpc2Q9R244 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Trpc2Q9R244 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trpc2Q9R244 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Trpc2Q9R244 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Trpc2Q9R244 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trpc2Q9R244 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trpc2Q9R244 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Trpc2Q9R244 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trpc2Q9R244 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trpc2Q9R244 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trpc2Q9R244 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trpc2Q9R244 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trpc2Q9R244 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trpc2Q9R244 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trpc2Q9R244 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Trpc2Q9R244 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trpc2Q9R244 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trpc2Q9R244 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trpc2Q9R244 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trpc2Q9R244 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Trpc2Q9R244 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms