Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E2

Plod1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod1Q9R0E2 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Plod1Q9R0E2 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Plod1Q9R0E2 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Plod1Q9R0E2 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Plod1Q9R0E2 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Plod1Q9R0E2 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Plod1Q9R0E2 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Plod1Q9R0E2 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Plod1Q9R0E2 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Plod1Q9R0E2 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Plod1Q9R0E2 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Plod1Q9R0E2 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Plod1Q9R0E2 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Plod1Q9R0E2 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Plod1Q9R0E2 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Plod1Q9R0E2 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Plod1Q9R0E2 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Plod1Q9R0E2 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Plod1Q9R0E2 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Plod1Q9R0E2 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Plod1Q9R0E2 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Plod1Q9R0E2 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Plod1Q9R0E2 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Plod1Q9R0E2 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Plod1Q9R0E2 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Plod1Q9R0E2 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Plod1Q9R0E2 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Plod1Q9R0E2 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Plod1Q9R0E2 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Plod1Q9R0E2 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Plod1Q9R0E2 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Plod1Q9R0E2 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Plod1Q9R0E2 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Plod1Q9R0E2 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Plod1Q9R0E2 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Plod1Q9R0E2 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Plod1Q9R0E2 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Plod1Q9R0E2 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Plod1Q9R0E2 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Plod1Q9R0E2 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Plod1Q9R0E2 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Plod1Q9R0E2 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Plod1Q9R0E2 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Plod1Q9R0E2 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Plod1Q9R0E2 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Plod1Q9R0E2 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Plod1Q9R0E2 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Plod1Q9R0E2 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Plod1Q9R0E2 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Plod1Q9R0E2 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Plod1Q9R0E2 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Plod1Q9R0E2 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Plod1Q9R0E2 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Plod1Q9R0E2 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Plod1Q9R0E2 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Plod1Q9R0E2 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Plod1Q9R0E2 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Plod1Q9R0E2 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Plod1Q9R0E2 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Plod1Q9R0E2 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Plod1Q9R0E2 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Plod1Q9R0E2 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Plod1Q9R0E2 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Plod1Q9R0E2 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Plod1Q9R0E2 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Plod1Q9R0E2 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Plod1Q9R0E2 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Plod1Q9R0E2 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Plod1Q9R0E2 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Plod1Q9R0E2 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Plod1Q9R0E2 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Plod1Q9R0E2 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Plod1Q9R0E2 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Plod1Q9R0E2 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Plod1Q9R0E2 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Plod1Q9R0E2 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Plod1Q9R0E2 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Plod1Q9R0E2 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Plod1Q9R0E2 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Plod1Q9R0E2 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Plod1Q9R0E2 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Plod1Q9R0E2 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Plod1Q9R0E2 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Plod1Q9R0E2 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Plod1Q9R0E2 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Plod1Q9R0E2 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Plod1Q9R0E2 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Plod1Q9R0E2 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Plod1Q9R0E2 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Plod1Q9R0E2 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Plod1Q9R0E2 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Plod1Q9R0E2 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Plod1Q9R0E2 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Plod1Q9R0E2 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Plod1Q9R0E2 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Plod1Q9R0E2 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Plod1Q9R0E2 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Plod1Q9R0E2 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Plod1Q9R0E2 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Plod1Q9R0E2 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms