Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA7

Trim44, Tripartite motif-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim44Q9QXA7 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Trim44Q9QXA7 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trim44Q9QXA7 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trim44Q9QXA7 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trim44Q9QXA7 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trim44Q9QXA7 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trim44Q9QXA7 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trim44Q9QXA7 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trim44Q9QXA7 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trim44Q9QXA7 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trim44Q9QXA7 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trim44Q9QXA7 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trim44Q9QXA7 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trim44Q9QXA7 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trim44Q9QXA7 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Trim44Q9QXA7 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trim44Q9QXA7 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trim44Q9QXA7 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trim44Q9QXA7 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trim44Q9QXA7 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trim44Q9QXA7 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trim44Q9QXA7 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trim44Q9QXA7 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trim44Q9QXA7 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trim44Q9QXA7 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trim44Q9QXA7 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trim44Q9QXA7 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trim44Q9QXA7 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trim44Q9QXA7 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trim44Q9QXA7 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trim44Q9QXA7 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trim44Q9QXA7 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trim44Q9QXA7 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trim44Q9QXA7 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trim44Q9QXA7 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trim44Q9QXA7 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trim44Q9QXA7 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trim44Q9QXA7 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trim44Q9QXA7 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trim44Q9QXA7 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Trim44Q9QXA7 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Trim44Q9QXA7 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trim44Q9QXA7 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trim44Q9QXA7 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trim44Q9QXA7 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trim44Q9QXA7 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trim44Q9QXA7 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trim44Q9QXA7 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trim44Q9QXA7 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trim44Q9QXA7 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trim44Q9QXA7 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trim44Q9QXA7 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trim44Q9QXA7 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trim44Q9QXA7 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trim44Q9QXA7 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Trim44Q9QXA7 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Trim44Q9QXA7 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trim44Q9QXA7 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trim44Q9QXA7 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trim44Q9QXA7 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trim44Q9QXA7 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trim44Q9QXA7 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trim44Q9QXA7 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trim44Q9QXA7 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trim44Q9QXA7 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trim44Q9QXA7 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Trim44Q9QXA7 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trim44Q9QXA7 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trim44Q9QXA7 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trim44Q9QXA7 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trim44Q9QXA7 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trim44Q9QXA7 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trim44Q9QXA7 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trim44Q9QXA7 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trim44Q9QXA7 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trim44Q9QXA7 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trim44Q9QXA7 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trim44Q9QXA7 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trim44Q9QXA7 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trim44Q9QXA7 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trim44Q9QXA7 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trim44Q9QXA7 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trim44Q9QXA7 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trim44Q9QXA7 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trim44Q9QXA7 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trim44Q9QXA7 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trim44Q9QXA7 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trim44Q9QXA7 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trim44Q9QXA7 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trim44Q9QXA7 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trim44Q9QXA7 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trim44Q9QXA7 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trim44Q9QXA7 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trim44Q9QXA7 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trim44Q9QXA7 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trim44Q9QXA7 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trim44Q9QXA7 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trim44Q9QXA7 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trim44Q9QXA7 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trim44Q9QXA7 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.5 ms