Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX66

Dpf1, Zinc finger protein neuro-d4, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf1Q9QX66 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dpf1Q9QX66 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dpf1Q9QX66 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dpf1Q9QX66 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dpf1Q9QX66 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dpf1Q9QX66 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dpf1Q9QX66 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dpf1Q9QX66 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dpf1Q9QX66 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dpf1Q9QX66 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dpf1Q9QX66 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dpf1Q9QX66 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dpf1Q9QX66 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dpf1Q9QX66 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dpf1Q9QX66 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dpf1Q9QX66 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dpf1Q9QX66 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dpf1Q9QX66 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dpf1Q9QX66 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dpf1Q9QX66 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dpf1Q9QX66 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dpf1Q9QX66 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dpf1Q9QX66 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dpf1Q9QX66 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dpf1Q9QX66 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dpf1Q9QX66 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dpf1Q9QX66 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dpf1Q9QX66 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dpf1Q9QX66 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dpf1Q9QX66 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dpf1Q9QX66 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dpf1Q9QX66 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dpf1Q9QX66 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dpf1Q9QX66 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dpf1Q9QX66 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dpf1Q9QX66 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dpf1Q9QX66 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dpf1Q9QX66 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dpf1Q9QX66 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dpf1Q9QX66 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dpf1Q9QX66 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Dpf1Q9QX66 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dpf1Q9QX66 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dpf1Q9QX66 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dpf1Q9QX66 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dpf1Q9QX66 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dpf1Q9QX66 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dpf1Q9QX66 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dpf1Q9QX66 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dpf1Q9QX66 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dpf1Q9QX66 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dpf1Q9QX66 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dpf1Q9QX66 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dpf1Q9QX66 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dpf1Q9QX66 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dpf1Q9QX66 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dpf1Q9QX66 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dpf1Q9QX66 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dpf1Q9QX66 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dpf1Q9QX66 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dpf1Q9QX66 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dpf1Q9QX66 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dpf1Q9QX66 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dpf1Q9QX66 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dpf1Q9QX66 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dpf1Q9QX66 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dpf1Q9QX66 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dpf1Q9QX66 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dpf1Q9QX66 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dpf1Q9QX66 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dpf1Q9QX66 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dpf1Q9QX66 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dpf1Q9QX66 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dpf1Q9QX66 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dpf1Q9QX66 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dpf1Q9QX66 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dpf1Q9QX66 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dpf1Q9QX66 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dpf1Q9QX66 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dpf1Q9QX66 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dpf1Q9QX66 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dpf1Q9QX66 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Dpf1Q9QX66 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dpf1Q9QX66 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Dpf1Q9QX66 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dpf1Q9QX66 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dpf1Q9QX66 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dpf1Q9QX66 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dpf1Q9QX66 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dpf1Q9QX66 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dpf1Q9QX66 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dpf1Q9QX66 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dpf1Q9QX66 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dpf1Q9QX66 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dpf1Q9QX66 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dpf1Q9QX66 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dpf1Q9QX66 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dpf1Q9QX66 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dpf1Q9QX66 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dpf1Q9QX66 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms