Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX29

Trpc5, Short transient receptor potential channel 5, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc5Q9QX29 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trpc5Q9QX29 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trpc5Q9QX29 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trpc5Q9QX29 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trpc5Q9QX29 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trpc5Q9QX29 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Trpc5Q9QX29 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trpc5Q9QX29 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trpc5Q9QX29 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trpc5Q9QX29 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trpc5Q9QX29 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trpc5Q9QX29 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trpc5Q9QX29 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trpc5Q9QX29 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trpc5Q9QX29 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trpc5Q9QX29 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trpc5Q9QX29 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trpc5Q9QX29 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trpc5Q9QX29 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trpc5Q9QX29 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trpc5Q9QX29 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trpc5Q9QX29 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trpc5Q9QX29 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trpc5Q9QX29 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trpc5Q9QX29 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trpc5Q9QX29 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trpc5Q9QX29 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trpc5Q9QX29 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Trpc5Q9QX29 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trpc5Q9QX29 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trpc5Q9QX29 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Trpc5Q9QX29 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trpc5Q9QX29 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trpc5Q9QX29 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trpc5Q9QX29 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trpc5Q9QX29 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trpc5Q9QX29 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trpc5Q9QX29 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trpc5Q9QX29 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trpc5Q9QX29 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trpc5Q9QX29 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trpc5Q9QX29 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trpc5Q9QX29 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trpc5Q9QX29 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trpc5Q9QX29 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trpc5Q9QX29 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trpc5Q9QX29 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trpc5Q9QX29 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trpc5Q9QX29 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trpc5Q9QX29 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trpc5Q9QX29 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trpc5Q9QX29 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trpc5Q9QX29 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trpc5Q9QX29 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trpc5Q9QX29 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trpc5Q9QX29 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trpc5Q9QX29 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trpc5Q9QX29 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trpc5Q9QX29 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trpc5Q9QX29 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Trpc5Q9QX29 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trpc5Q9QX29 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trpc5Q9QX29 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trpc5Q9QX29 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trpc5Q9QX29 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trpc5Q9QX29 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trpc5Q9QX29 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Trpc5Q9QX29 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trpc5Q9QX29 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trpc5Q9QX29 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Trpc5Q9QX29 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trpc5Q9QX29 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trpc5Q9QX29 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trpc5Q9QX29 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trpc5Q9QX29 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trpc5Q9QX29 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trpc5Q9QX29 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trpc5Q9QX29 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trpc5Q9QX29 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trpc5Q9QX29 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trpc5Q9QX29 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trpc5Q9QX29 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trpc5Q9QX29 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Trpc5Q9QX29 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trpc5Q9QX29 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trpc5Q9QX29 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trpc5Q9QX29 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trpc5Q9QX29 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Trpc5Q9QX29 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trpc5Q9QX29 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trpc5Q9QX29 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trpc5Q9QX29 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trpc5Q9QX29 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trpc5Q9QX29 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Trpc5Q9QX29 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Trpc5Q9QX29 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trpc5Q9QX29 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trpc5Q9QX29 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trpc5Q9QX29 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Trpc5Q9QX29 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms