Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rabgef1Q9JM13 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rabgef1Q9JM13 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rabgef1Q9JM13 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rabgef1Q9JM13 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rabgef1Q9JM13 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rabgef1Q9JM13 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rabgef1Q9JM13 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rabgef1Q9JM13 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rabgef1Q9JM13 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rabgef1Q9JM13 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rabgef1Q9JM13 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rabgef1Q9JM13 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rabgef1Q9JM13 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rabgef1Q9JM13 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rabgef1Q9JM13 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rabgef1Q9JM13 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rabgef1Q9JM13 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rabgef1Q9JM13 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rabgef1Q9JM13 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rabgef1Q9JM13 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rabgef1Q9JM13 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rabgef1Q9JM13 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rabgef1Q9JM13 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rabgef1Q9JM13 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rabgef1Q9JM13 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rabgef1Q9JM13 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rabgef1Q9JM13 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rabgef1Q9JM13 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rabgef1Q9JM13 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rabgef1Q9JM13 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rabgef1Q9JM13 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rabgef1Q9JM13 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rabgef1Q9JM13 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rabgef1Q9JM13 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rabgef1Q9JM13 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rabgef1Q9JM13 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rabgef1Q9JM13 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rabgef1Q9JM13 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rabgef1Q9JM13 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rabgef1Q9JM13 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rabgef1Q9JM13 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rabgef1Q9JM13 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rabgef1Q9JM13 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rabgef1Q9JM13 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rabgef1Q9JM13 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rabgef1Q9JM13 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rabgef1Q9JM13 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rabgef1Q9JM13 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rabgef1Q9JM13 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rabgef1Q9JM13 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rabgef1Q9JM13 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rabgef1Q9JM13 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rabgef1Q9JM13 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rabgef1Q9JM13 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rabgef1Q9JM13 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rabgef1Q9JM13 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rabgef1Q9JM13 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rabgef1Q9JM13 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rabgef1Q9JM13 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rabgef1Q9JM13 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rabgef1Q9JM13 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Rabgef1Q9JM13 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rabgef1Q9JM13 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rabgef1Q9JM13 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rabgef1Q9JM13 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rabgef1Q9JM13 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rabgef1Q9JM13 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rabgef1Q9JM13 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rabgef1Q9JM13 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rabgef1Q9JM13 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rabgef1Q9JM13 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rabgef1Q9JM13 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rabgef1Q9JM13 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rabgef1Q9JM13 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rabgef1Q9JM13 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rabgef1Q9JM13 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rabgef1Q9JM13 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rabgef1Q9JM13 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rabgef1Q9JM13 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rabgef1Q9JM13 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rabgef1Q9JM13 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rabgef1Q9JM13 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rabgef1Q9JM13 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rabgef1Q9JM13 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rabgef1Q9JM13 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rabgef1Q9JM13 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rabgef1Q9JM13 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rabgef1Q9JM13 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rabgef1Q9JM13 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rabgef1Q9JM13 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rabgef1Q9JM13 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rabgef1Q9JM13 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rabgef1Q9JM13 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rabgef1Q9JM13 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rabgef1Q9JM13 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rabgef1Q9JM13 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rabgef1Q9JM13 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rabgef1Q9JM13 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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