Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKV5

Scamp4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp4Q9JKV5 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scamp4Q9JKV5 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scamp4Q9JKV5 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scamp4Q9JKV5 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scamp4Q9JKV5 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scamp4Q9JKV5 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scamp4Q9JKV5 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Scamp4Q9JKV5 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scamp4Q9JKV5 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scamp4Q9JKV5 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scamp4Q9JKV5 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Scamp4Q9JKV5 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scamp4Q9JKV5 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scamp4Q9JKV5 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scamp4Q9JKV5 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scamp4Q9JKV5 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Scamp4Q9JKV5 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scamp4Q9JKV5 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scamp4Q9JKV5 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scamp4Q9JKV5 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scamp4Q9JKV5 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scamp4Q9JKV5 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scamp4Q9JKV5 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scamp4Q9JKV5 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scamp4Q9JKV5 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scamp4Q9JKV5 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Scamp4Q9JKV5 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scamp4Q9JKV5 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scamp4Q9JKV5 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scamp4Q9JKV5 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scamp4Q9JKV5 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scamp4Q9JKV5 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Scamp4Q9JKV5 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scamp4Q9JKV5 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scamp4Q9JKV5 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scamp4Q9JKV5 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scamp4Q9JKV5 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scamp4Q9JKV5 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scamp4Q9JKV5 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scamp4Q9JKV5 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Scamp4Q9JKV5 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scamp4Q9JKV5 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scamp4Q9JKV5 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scamp4Q9JKV5 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scamp4Q9JKV5 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scamp4Q9JKV5 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Scamp4Q9JKV5 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Scamp4Q9JKV5 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scamp4Q9JKV5 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scamp4Q9JKV5 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scamp4Q9JKV5 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Scamp4Q9JKV5 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scamp4Q9JKV5 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scamp4Q9JKV5 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Scamp4Q9JKV5 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scamp4Q9JKV5 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scamp4Q9JKV5 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scamp4Q9JKV5 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scamp4Q9JKV5 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scamp4Q9JKV5 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scamp4Q9JKV5 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scamp4Q9JKV5 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scamp4Q9JKV5 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scamp4Q9JKV5 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scamp4Q9JKV5 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scamp4Q9JKV5 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scamp4Q9JKV5 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scamp4Q9JKV5 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scamp4Q9JKV5 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scamp4Q9JKV5 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scamp4Q9JKV5 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scamp4Q9JKV5 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scamp4Q9JKV5 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scamp4Q9JKV5 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scamp4Q9JKV5 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scamp4Q9JKV5 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scamp4Q9JKV5 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scamp4Q9JKV5 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scamp4Q9JKV5 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scamp4Q9JKV5 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scamp4Q9JKV5 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scamp4Q9JKV5 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scamp4Q9JKV5 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scamp4Q9JKV5 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scamp4Q9JKV5 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scamp4Q9JKV5 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scamp4Q9JKV5 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scamp4Q9JKV5 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scamp4Q9JKV5 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scamp4Q9JKV5 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scamp4Q9JKV5 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scamp4Q9JKV5 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scamp4Q9JKV5 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scamp4Q9JKV5 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Scamp4Q9JKV5 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scamp4Q9JKV5 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scamp4Q9JKV5 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scamp4Q9JKV5 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scamp4Q9JKV5 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scamp4Q9JKV5 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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