Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scamp5Q9JKD3 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scamp5Q9JKD3 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scamp5Q9JKD3 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scamp5Q9JKD3 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scamp5Q9JKD3 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scamp5Q9JKD3 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scamp5Q9JKD3 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scamp5Q9JKD3 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scamp5Q9JKD3 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scamp5Q9JKD3 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scamp5Q9JKD3 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scamp5Q9JKD3 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scamp5Q9JKD3 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scamp5Q9JKD3 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scamp5Q9JKD3 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scamp5Q9JKD3 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scamp5Q9JKD3 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scamp5Q9JKD3 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Scamp5Q9JKD3 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scamp5Q9JKD3 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scamp5Q9JKD3 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scamp5Q9JKD3 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scamp5Q9JKD3 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scamp5Q9JKD3 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scamp5Q9JKD3 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scamp5Q9JKD3 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scamp5Q9JKD3 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scamp5Q9JKD3 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scamp5Q9JKD3 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scamp5Q9JKD3 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scamp5Q9JKD3 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scamp5Q9JKD3 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scamp5Q9JKD3 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scamp5Q9JKD3 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scamp5Q9JKD3 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scamp5Q9JKD3 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scamp5Q9JKD3 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scamp5Q9JKD3 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scamp5Q9JKD3 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scamp5Q9JKD3 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scamp5Q9JKD3 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scamp5Q9JKD3 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scamp5Q9JKD3 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scamp5Q9JKD3 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scamp5Q9JKD3 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scamp5Q9JKD3 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scamp5Q9JKD3 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scamp5Q9JKD3 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scamp5Q9JKD3 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scamp5Q9JKD3 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scamp5Q9JKD3 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scamp5Q9JKD3 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scamp5Q9JKD3 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scamp5Q9JKD3 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scamp5Q9JKD3 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scamp5Q9JKD3 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scamp5Q9JKD3 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scamp5Q9JKD3 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scamp5Q9JKD3 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scamp5Q9JKD3 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scamp5Q9JKD3 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scamp5Q9JKD3 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scamp5Q9JKD3 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scamp5Q9JKD3 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scamp5Q9JKD3 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scamp5Q9JKD3 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scamp5Q9JKD3 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scamp5Q9JKD3 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scamp5Q9JKD3 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scamp5Q9JKD3 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scamp5Q9JKD3 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scamp5Q9JKD3 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Scamp5Q9JKD3 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scamp5Q9JKD3 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Scamp5Q9JKD3 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Scamp5Q9JKD3 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Scamp5Q9JKD3 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Scamp5Q9JKD3 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scamp5Q9JKD3 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Scamp5Q9JKD3 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scamp5Q9JKD3 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scamp5Q9JKD3 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scamp5Q9JKD3 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scamp5Q9JKD3 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scamp5Q9JKD3 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Scamp5Q9JKD3 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scamp5Q9JKD3 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scamp5Q9JKD3 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Scamp5Q9JKD3 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scamp5Q9JKD3 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scamp5Q9JKD3 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scamp5Q9JKD3 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Scamp5Q9JKD3 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Scamp5Q9JKD3 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Scamp5Q9JKD3 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Scamp5Q9JKD3 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Scamp5Q9JKD3 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Scamp5Q9JKD3 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Scamp5Q9JKD3 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms