Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK54

Msgn1, Mesogenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msgn1Q9JK54 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Msgn1Q9JK54 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Msgn1Q9JK54 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Msgn1Q9JK54 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Msgn1Q9JK54 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Msgn1Q9JK54 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Msgn1Q9JK54 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Msgn1Q9JK54 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Msgn1Q9JK54 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Msgn1Q9JK54 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Msgn1Q9JK54 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Msgn1Q9JK54 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Msgn1Q9JK54 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Msgn1Q9JK54 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Msgn1Q9JK54 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Msgn1Q9JK54 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Msgn1Q9JK54 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Msgn1Q9JK54 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Msgn1Q9JK54 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Msgn1Q9JK54 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Msgn1Q9JK54 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Msgn1Q9JK54 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Msgn1Q9JK54 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Msgn1Q9JK54 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Msgn1Q9JK54 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Msgn1Q9JK54 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Msgn1Q9JK54 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Msgn1Q9JK54 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Msgn1Q9JK54 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Msgn1Q9JK54 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Msgn1Q9JK54 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Msgn1Q9JK54 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Msgn1Q9JK54 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Msgn1Q9JK54 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Msgn1Q9JK54 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Msgn1Q9JK54 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Msgn1Q9JK54 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Msgn1Q9JK54 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Msgn1Q9JK54 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Msgn1Q9JK54 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Msgn1Q9JK54 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Msgn1Q9JK54 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Msgn1Q9JK54 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Msgn1Q9JK54 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Msgn1Q9JK54 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Msgn1Q9JK54 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Msgn1Q9JK54 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Msgn1Q9JK54 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Msgn1Q9JK54 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Msgn1Q9JK54 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Msgn1Q9JK54 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Msgn1Q9JK54 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Msgn1Q9JK54 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Msgn1Q9JK54 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Msgn1Q9JK54 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Msgn1Q9JK54 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Msgn1Q9JK54 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Msgn1Q9JK54 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Msgn1Q9JK54 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Msgn1Q9JK54 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Msgn1Q9JK54 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Msgn1Q9JK54 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Msgn1Q9JK54 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Msgn1Q9JK54 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Msgn1Q9JK54 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Msgn1Q9JK54 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Msgn1Q9JK54 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Msgn1Q9JK54 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Msgn1Q9JK54 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Msgn1Q9JK54 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Msgn1Q9JK54 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Msgn1Q9JK54 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Msgn1Q9JK54 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Msgn1Q9JK54 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Msgn1Q9JK54 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Msgn1Q9JK54 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Msgn1Q9JK54 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Msgn1Q9JK54 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Msgn1Q9JK54 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Msgn1Q9JK54 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Msgn1Q9JK54 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Msgn1Q9JK54 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Msgn1Q9JK54 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Msgn1Q9JK54 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Msgn1Q9JK54 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Msgn1Q9JK54 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Msgn1Q9JK54 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Msgn1Q9JK54 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Msgn1Q9JK54 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Msgn1Q9JK54 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Msgn1Q9JK54 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Msgn1Q9JK54 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Msgn1Q9JK54 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Msgn1Q9JK54 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Msgn1Q9JK54 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Msgn1Q9JK54 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Msgn1Q9JK54 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Msgn1Q9JK54 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Msgn1Q9JK54 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Msgn1Q9JK54 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms