Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT2

Gfra4, GDNF family receptor alpha-4, mousemouse

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Length 260 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra4Q9JJT2 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gfra4Q9JJT2 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gfra4Q9JJT2 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gfra4Q9JJT2 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gfra4Q9JJT2 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gfra4Q9JJT2 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gfra4Q9JJT2 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gfra4Q9JJT2 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gfra4Q9JJT2 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gfra4Q9JJT2 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gfra4Q9JJT2 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gfra4Q9JJT2 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gfra4Q9JJT2 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gfra4Q9JJT2 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gfra4Q9JJT2 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gfra4Q9JJT2 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gfra4Q9JJT2 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gfra4Q9JJT2 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gfra4Q9JJT2 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gfra4Q9JJT2 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gfra4Q9JJT2 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gfra4Q9JJT2 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gfra4Q9JJT2 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gfra4Q9JJT2 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gfra4Q9JJT2 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gfra4Q9JJT2 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gfra4Q9JJT2 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gfra4Q9JJT2 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gfra4Q9JJT2 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gfra4Q9JJT2 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gfra4Q9JJT2 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gfra4Q9JJT2 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gfra4Q9JJT2 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gfra4Q9JJT2 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gfra4Q9JJT2 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gfra4Q9JJT2 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gfra4Q9JJT2 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gfra4Q9JJT2 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gfra4Q9JJT2 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gfra4Q9JJT2 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gfra4Q9JJT2 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gfra4Q9JJT2 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gfra4Q9JJT2 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gfra4Q9JJT2 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gfra4Q9JJT2 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gfra4Q9JJT2 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gfra4Q9JJT2 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gfra4Q9JJT2 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gfra4Q9JJT2 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gfra4Q9JJT2 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gfra4Q9JJT2 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gfra4Q9JJT2 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gfra4Q9JJT2 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gfra4Q9JJT2 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gfra4Q9JJT2 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gfra4Q9JJT2 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gfra4Q9JJT2 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gfra4Q9JJT2 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gfra4Q9JJT2 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gfra4Q9JJT2 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gfra4Q9JJT2 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gfra4Q9JJT2 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gfra4Q9JJT2 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gfra4Q9JJT2 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gfra4Q9JJT2 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gfra4Q9JJT2 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gfra4Q9JJT2 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gfra4Q9JJT2 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gfra4Q9JJT2 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gfra4Q9JJT2 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gfra4Q9JJT2 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gfra4Q9JJT2 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gfra4Q9JJT2 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gfra4Q9JJT2 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gfra4Q9JJT2 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gfra4Q9JJT2 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gfra4Q9JJT2 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gfra4Q9JJT2 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gfra4Q9JJT2 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gfra4Q9JJT2 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gfra4Q9JJT2 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gfra4Q9JJT2 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gfra4Q9JJT2 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gfra4Q9JJT2 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gfra4Q9JJT2 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gfra4Q9JJT2 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gfra4Q9JJT2 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gfra4Q9JJT2 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gfra4Q9JJT2 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gfra4Q9JJT2 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gfra4Q9JJT2 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gfra4Q9JJT2 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gfra4Q9JJT2 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gfra4Q9JJT2 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gfra4Q9JJT2 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gfra4Q9JJT2 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gfra4Q9JJT2 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gfra4Q9JJT2 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gfra4Q9JJT2 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gfra4Q9JJT2 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms