Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHW9

Aldh1a3, Aldehyde dehydrogenase family 1 member A3, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh1a3Q9JHW9 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Aldh1a3Q9JHW9 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Aldh1a3Q9JHW9 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Aldh1a3Q9JHW9 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Aldh1a3Q9JHW9 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Aldh1a3Q9JHW9 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Aldh1a3Q9JHW9 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Aldh1a3Q9JHW9 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Aldh1a3Q9JHW9 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Aldh1a3Q9JHW9 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Aldh1a3Q9JHW9 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Aldh1a3Q9JHW9 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Aldh1a3Q9JHW9 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Aldh1a3Q9JHW9 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Aldh1a3Q9JHW9 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Aldh1a3Q9JHW9 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Aldh1a3Q9JHW9 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Aldh1a3Q9JHW9 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Aldh1a3Q9JHW9 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Aldh1a3Q9JHW9 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Aldh1a3Q9JHW9 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Aldh1a3Q9JHW9 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Aldh1a3Q9JHW9 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Aldh1a3Q9JHW9 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Aldh1a3Q9JHW9 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Aldh1a3Q9JHW9 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Aldh1a3Q9JHW9 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Aldh1a3Q9JHW9 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Aldh1a3Q9JHW9 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Aldh1a3Q9JHW9 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Aldh1a3Q9JHW9 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Aldh1a3Q9JHW9 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Aldh1a3Q9JHW9 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Aldh1a3Q9JHW9 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Aldh1a3Q9JHW9 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Aldh1a3Q9JHW9 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Aldh1a3Q9JHW9 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Aldh1a3Q9JHW9 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Aldh1a3Q9JHW9 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Aldh1a3Q9JHW9 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Aldh1a3Q9JHW9 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Aldh1a3Q9JHW9 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Aldh1a3Q9JHW9 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Aldh1a3Q9JHW9 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Aldh1a3Q9JHW9 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Aldh1a3Q9JHW9 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Aldh1a3Q9JHW9 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Aldh1a3Q9JHW9 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Aldh1a3Q9JHW9 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Aldh1a3Q9JHW9 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Aldh1a3Q9JHW9 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Aldh1a3Q9JHW9 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Aldh1a3Q9JHW9 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Aldh1a3Q9JHW9 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Aldh1a3Q9JHW9 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Aldh1a3Q9JHW9 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Aldh1a3Q9JHW9 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Aldh1a3Q9JHW9 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Aldh1a3Q9JHW9 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Aldh1a3Q9JHW9 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Aldh1a3Q9JHW9 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Aldh1a3Q9JHW9 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Aldh1a3Q9JHW9 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Aldh1a3Q9JHW9 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Aldh1a3Q9JHW9 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Aldh1a3Q9JHW9 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Aldh1a3Q9JHW9 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Aldh1a3Q9JHW9 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Aldh1a3Q9JHW9 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Aldh1a3Q9JHW9 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Aldh1a3Q9JHW9 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Aldh1a3Q9JHW9 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Aldh1a3Q9JHW9 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Aldh1a3Q9JHW9 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Aldh1a3Q9JHW9 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Aldh1a3Q9JHW9 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Aldh1a3Q9JHW9 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Aldh1a3Q9JHW9 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Aldh1a3Q9JHW9 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Aldh1a3Q9JHW9 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Aldh1a3Q9JHW9 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Aldh1a3Q9JHW9 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Aldh1a3Q9JHW9 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Aldh1a3Q9JHW9 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Aldh1a3Q9JHW9 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Aldh1a3Q9JHW9 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Aldh1a3Q9JHW9 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Aldh1a3Q9JHW9 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Aldh1a3Q9JHW9 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Aldh1a3Q9JHW9 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Aldh1a3Q9JHW9 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Aldh1a3Q9JHW9 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Aldh1a3Q9JHW9 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Aldh1a3Q9JHW9 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Aldh1a3Q9JHW9 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Aldh1a3Q9JHW9 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Aldh1a3Q9JHW9 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Aldh1a3Q9JHW9 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Aldh1a3Q9JHW9 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Aldh1a3Q9JHW9 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms