Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERK4

Cse1l, Exportin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cse1lQ9ERK4 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cse1lQ9ERK4 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cse1lQ9ERK4 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cse1lQ9ERK4 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cse1lQ9ERK4 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cse1lQ9ERK4 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cse1lQ9ERK4 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cse1lQ9ERK4 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cse1lQ9ERK4 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cse1lQ9ERK4 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cse1lQ9ERK4 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cse1lQ9ERK4 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cse1lQ9ERK4 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cse1lQ9ERK4 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cse1lQ9ERK4 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cse1lQ9ERK4 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cse1lQ9ERK4 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cse1lQ9ERK4 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cse1lQ9ERK4 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cse1lQ9ERK4 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cse1lQ9ERK4 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cse1lQ9ERK4 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cse1lQ9ERK4 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cse1lQ9ERK4 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cse1lQ9ERK4 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cse1lQ9ERK4 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cse1lQ9ERK4 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cse1lQ9ERK4 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cse1lQ9ERK4 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cse1lQ9ERK4 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cse1lQ9ERK4 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cse1lQ9ERK4 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cse1lQ9ERK4 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cse1lQ9ERK4 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cse1lQ9ERK4 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cse1lQ9ERK4 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cse1lQ9ERK4 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cse1lQ9ERK4 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cse1lQ9ERK4 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cse1lQ9ERK4 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cse1lQ9ERK4 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cse1lQ9ERK4 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cse1lQ9ERK4 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cse1lQ9ERK4 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cse1lQ9ERK4 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cse1lQ9ERK4 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cse1lQ9ERK4 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cse1lQ9ERK4 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cse1lQ9ERK4 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cse1lQ9ERK4 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cse1lQ9ERK4 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cse1lQ9ERK4 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cse1lQ9ERK4 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cse1lQ9ERK4 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cse1lQ9ERK4 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cse1lQ9ERK4 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cse1lQ9ERK4 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cse1lQ9ERK4 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cse1lQ9ERK4 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cse1lQ9ERK4 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cse1lQ9ERK4 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cse1lQ9ERK4 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cse1lQ9ERK4 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cse1lQ9ERK4 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cse1lQ9ERK4 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cse1lQ9ERK4 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cse1lQ9ERK4 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cse1lQ9ERK4 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cse1lQ9ERK4 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cse1lQ9ERK4 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cse1lQ9ERK4 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cse1lQ9ERK4 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cse1lQ9ERK4 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cse1lQ9ERK4 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cse1lQ9ERK4 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cse1lQ9ERK4 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cse1lQ9ERK4 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cse1lQ9ERK4 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cse1lQ9ERK4 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cse1lQ9ERK4 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cse1lQ9ERK4 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cse1lQ9ERK4 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cse1lQ9ERK4 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cse1lQ9ERK4 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cse1lQ9ERK4 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cse1lQ9ERK4 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cse1lQ9ERK4 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cse1lQ9ERK4 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cse1lQ9ERK4 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cse1lQ9ERK4 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cse1lQ9ERK4 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cse1lQ9ERK4 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cse1lQ9ERK4 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cse1lQ9ERK4 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cse1lQ9ERK4 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cse1lQ9ERK4 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cse1lQ9ERK4 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cse1lQ9ERK4 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cse1lQ9ERK4 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cse1lQ9ERK4 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms