Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER56

Capn12, Calpain-12, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn12Q9ER56 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capn12Q9ER56 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capn12Q9ER56 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capn12Q9ER56 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capn12Q9ER56 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capn12Q9ER56 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capn12Q9ER56 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capn12Q9ER56 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capn12Q9ER56 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capn12Q9ER56 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capn12Q9ER56 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capn12Q9ER56 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capn12Q9ER56 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capn12Q9ER56 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capn12Q9ER56 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capn12Q9ER56 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capn12Q9ER56 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capn12Q9ER56 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capn12Q9ER56 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capn12Q9ER56 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capn12Q9ER56 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capn12Q9ER56 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capn12Q9ER56 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capn12Q9ER56 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Capn12Q9ER56 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Capn12Q9ER56 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Capn12Q9ER56 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Capn12Q9ER56 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Capn12Q9ER56 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Capn12Q9ER56 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Capn12Q9ER56 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Capn12Q9ER56 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Capn12Q9ER56 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Capn12Q9ER56 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Capn12Q9ER56 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Capn12Q9ER56 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Capn12Q9ER56 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Capn12Q9ER56 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Capn12Q9ER56 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Capn12Q9ER56 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Capn12Q9ER56 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Capn12Q9ER56 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Capn12Q9ER56 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Capn12Q9ER56 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Capn12Q9ER56 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Capn12Q9ER56 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Capn12Q9ER56 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Capn12Q9ER56 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Capn12Q9ER56 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Capn12Q9ER56 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Capn12Q9ER56 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Capn12Q9ER56 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Capn12Q9ER56 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Capn12Q9ER56 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Capn12Q9ER56 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Capn12Q9ER56 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Capn12Q9ER56 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Capn12Q9ER56 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Capn12Q9ER56 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Capn12Q9ER56 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Capn12Q9ER56 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Capn12Q9ER56 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Capn12Q9ER56 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Capn12Q9ER56 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Capn12Q9ER56 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Capn12Q9ER56 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Capn12Q9ER56 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Capn12Q9ER56 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Capn12Q9ER56 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Capn12Q9ER56 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Capn12Q9ER56 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Capn12Q9ER56 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Capn12Q9ER56 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Capn12Q9ER56 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Capn12Q9ER56 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Capn12Q9ER56 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Capn12Q9ER56 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Capn12Q9ER56 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Capn12Q9ER56 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Capn12Q9ER56 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Capn12Q9ER56 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Capn12Q9ER56 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Capn12Q9ER56 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Capn12Q9ER56 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Capn12Q9ER56 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Capn12Q9ER56 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Capn12Q9ER56 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Capn12Q9ER56 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Capn12Q9ER56 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Capn12Q9ER56 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Capn12Q9ER56 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Capn12Q9ER56 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Capn12Q9ER56 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Capn12Q9ER56 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Capn12Q9ER56 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Capn12Q9ER56 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Capn12Q9ER56 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Capn12Q9ER56 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Capn12Q9ER56 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Capn12Q9ER56 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms