Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ1

Tlr1, Toll-like receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr1Q9EPQ1 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tlr1Q9EPQ1 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tlr1Q9EPQ1 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tlr1Q9EPQ1 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tlr1Q9EPQ1 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tlr1Q9EPQ1 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tlr1Q9EPQ1 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tlr1Q9EPQ1 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tlr1Q9EPQ1 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tlr1Q9EPQ1 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tlr1Q9EPQ1 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tlr1Q9EPQ1 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tlr1Q9EPQ1 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tlr1Q9EPQ1 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tlr1Q9EPQ1 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tlr1Q9EPQ1 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tlr1Q9EPQ1 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tlr1Q9EPQ1 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tlr1Q9EPQ1 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tlr1Q9EPQ1 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tlr1Q9EPQ1 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tlr1Q9EPQ1 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tlr1Q9EPQ1 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tlr1Q9EPQ1 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Tlr1Q9EPQ1 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tlr1Q9EPQ1 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tlr1Q9EPQ1 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Tlr1Q9EPQ1 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tlr1Q9EPQ1 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tlr1Q9EPQ1 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tlr1Q9EPQ1 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tlr1Q9EPQ1 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tlr1Q9EPQ1 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tlr1Q9EPQ1 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tlr1Q9EPQ1 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tlr1Q9EPQ1 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tlr1Q9EPQ1 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tlr1Q9EPQ1 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tlr1Q9EPQ1 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tlr1Q9EPQ1 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tlr1Q9EPQ1 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tlr1Q9EPQ1 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tlr1Q9EPQ1 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tlr1Q9EPQ1 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Tlr1Q9EPQ1 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tlr1Q9EPQ1 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tlr1Q9EPQ1 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tlr1Q9EPQ1 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tlr1Q9EPQ1 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tlr1Q9EPQ1 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tlr1Q9EPQ1 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tlr1Q9EPQ1 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Tlr1Q9EPQ1 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tlr1Q9EPQ1 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tlr1Q9EPQ1 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tlr1Q9EPQ1 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tlr1Q9EPQ1 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Tlr1Q9EPQ1 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tlr1Q9EPQ1 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Tlr1Q9EPQ1 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tlr1Q9EPQ1 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tlr1Q9EPQ1 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tlr1Q9EPQ1 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tlr1Q9EPQ1 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Tlr1Q9EPQ1 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tlr1Q9EPQ1 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tlr1Q9EPQ1 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tlr1Q9EPQ1 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tlr1Q9EPQ1 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tlr1Q9EPQ1 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Tlr1Q9EPQ1 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tlr1Q9EPQ1 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tlr1Q9EPQ1 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tlr1Q9EPQ1 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tlr1Q9EPQ1 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tlr1Q9EPQ1 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tlr1Q9EPQ1 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tlr1Q9EPQ1 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tlr1Q9EPQ1 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tlr1Q9EPQ1 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tlr1Q9EPQ1 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tlr1Q9EPQ1 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Tlr1Q9EPQ1 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tlr1Q9EPQ1 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tlr1Q9EPQ1 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tlr1Q9EPQ1 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tlr1Q9EPQ1 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Tlr1Q9EPQ1 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tlr1Q9EPQ1 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tlr1Q9EPQ1 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tlr1Q9EPQ1 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tlr1Q9EPQ1 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tlr1Q9EPQ1 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tlr1Q9EPQ1 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tlr1Q9EPQ1 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms