Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC28

Csnk1d, Casein kinase I isoform delta, mousemouse

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1dQ9DC28 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Csnk1dQ9DC28 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Csnk1dQ9DC28 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Csnk1dQ9DC28 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Csnk1dQ9DC28 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Csnk1dQ9DC28 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Csnk1dQ9DC28 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Csnk1dQ9DC28 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Csnk1dQ9DC28 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Csnk1dQ9DC28 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Csnk1dQ9DC28 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Csnk1dQ9DC28 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Csnk1dQ9DC28 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Csnk1dQ9DC28 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Csnk1dQ9DC28 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Csnk1dQ9DC28 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Csnk1dQ9DC28 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Csnk1dQ9DC28 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Csnk1dQ9DC28 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Csnk1dQ9DC28 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Csnk1dQ9DC28 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Csnk1dQ9DC28 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Csnk1dQ9DC28 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Csnk1dQ9DC28 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Csnk1dQ9DC28 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Csnk1dQ9DC28 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Csnk1dQ9DC28 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Csnk1dQ9DC28 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Csnk1dQ9DC28 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Csnk1dQ9DC28 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Csnk1dQ9DC28 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Csnk1dQ9DC28 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Csnk1dQ9DC28 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Csnk1dQ9DC28 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Csnk1dQ9DC28 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Csnk1dQ9DC28 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Csnk1dQ9DC28 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Csnk1dQ9DC28 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Csnk1dQ9DC28 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Csnk1dQ9DC28 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Csnk1dQ9DC28 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Csnk1dQ9DC28 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Csnk1dQ9DC28 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Csnk1dQ9DC28 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Csnk1dQ9DC28 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Csnk1dQ9DC28 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Csnk1dQ9DC28 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Csnk1dQ9DC28 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Csnk1dQ9DC28 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Csnk1dQ9DC28 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Csnk1dQ9DC28 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Csnk1dQ9DC28 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Csnk1dQ9DC28 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Csnk1dQ9DC28 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Csnk1dQ9DC28 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Csnk1dQ9DC28 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Csnk1dQ9DC28 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Csnk1dQ9DC28 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Csnk1dQ9DC28 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Csnk1dQ9DC28 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Csnk1dQ9DC28 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Csnk1dQ9DC28 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Csnk1dQ9DC28 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Csnk1dQ9DC28 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Csnk1dQ9DC28 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Csnk1dQ9DC28 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Csnk1dQ9DC28 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Csnk1dQ9DC28 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Csnk1dQ9DC28 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Csnk1dQ9DC28 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Csnk1dQ9DC28 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Csnk1dQ9DC28 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Csnk1dQ9DC28 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Csnk1dQ9DC28 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Csnk1dQ9DC28 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Csnk1dQ9DC28 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Csnk1dQ9DC28 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Csnk1dQ9DC28 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Csnk1dQ9DC28 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Csnk1dQ9DC28 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Csnk1dQ9DC28 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Csnk1dQ9DC28 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Csnk1dQ9DC28 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Csnk1dQ9DC28 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Csnk1dQ9DC28 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Csnk1dQ9DC28 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Csnk1dQ9DC28 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Csnk1dQ9DC28 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Csnk1dQ9DC28 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Csnk1dQ9DC28 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Csnk1dQ9DC28 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Csnk1dQ9DC28 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Csnk1dQ9DC28 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Csnk1dQ9DC28 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Csnk1dQ9DC28 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Csnk1dQ9DC28 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Csnk1dQ9DC28 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
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