Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf6Q9DBU5 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf6Q9DBU5 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf6Q9DBU5 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf6Q9DBU5 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf6Q9DBU5 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf6Q9DBU5 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf6Q9DBU5 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf6Q9DBU5 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf6Q9DBU5 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf6Q9DBU5 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf6Q9DBU5 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf6Q9DBU5 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf6Q9DBU5 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf6Q9DBU5 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf6Q9DBU5 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf6Q9DBU5 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf6Q9DBU5 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf6Q9DBU5 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf6Q9DBU5 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf6Q9DBU5 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf6Q9DBU5 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf6Q9DBU5 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf6Q9DBU5 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf6Q9DBU5 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf6Q9DBU5 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf6Q9DBU5 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf6Q9DBU5 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf6Q9DBU5 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf6Q9DBU5 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf6Q9DBU5 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf6Q9DBU5 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf6Q9DBU5 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rnf6Q9DBU5 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rnf6Q9DBU5 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf6Q9DBU5 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf6Q9DBU5 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf6Q9DBU5 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf6Q9DBU5 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf6Q9DBU5 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf6Q9DBU5 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf6Q9DBU5 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf6Q9DBU5 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf6Q9DBU5 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf6Q9DBU5 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf6Q9DBU5 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf6Q9DBU5 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf6Q9DBU5 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf6Q9DBU5 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf6Q9DBU5 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf6Q9DBU5 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf6Q9DBU5 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf6Q9DBU5 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf6Q9DBU5 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf6Q9DBU5 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf6Q9DBU5 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf6Q9DBU5 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf6Q9DBU5 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf6Q9DBU5 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf6Q9DBU5 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf6Q9DBU5 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf6Q9DBU5 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf6Q9DBU5 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf6Q9DBU5 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf6Q9DBU5 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf6Q9DBU5 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf6Q9DBU5 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf6Q9DBU5 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf6Q9DBU5 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf6Q9DBU5 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf6Q9DBU5 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf6Q9DBU5 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf6Q9DBU5 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf6Q9DBU5 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf6Q9DBU5 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf6Q9DBU5 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf6Q9DBU5 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf6Q9DBU5 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf6Q9DBU5 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf6Q9DBU5 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf6Q9DBU5 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf6Q9DBU5 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf6Q9DBU5 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf6Q9DBU5 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf6Q9DBU5 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf6Q9DBU5 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf6Q9DBU5 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf6Q9DBU5 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf6Q9DBU5 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf6Q9DBU5 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf6Q9DBU5 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf6Q9DBU5 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf6Q9DBU5 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf6Q9DBU5 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf6Q9DBU5 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf6Q9DBU5 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf6Q9DBU5 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf6Q9DBU5 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf6Q9DBU5 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf6Q9DBU5 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms