Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBC3

Cmtr1, Cap-specific mRNA (nucleoside-2'-O-)-methyltransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtr1Q9DBC3 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cmtr1Q9DBC3 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cmtr1Q9DBC3 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cmtr1Q9DBC3 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cmtr1Q9DBC3 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cmtr1Q9DBC3 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cmtr1Q9DBC3 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cmtr1Q9DBC3 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cmtr1Q9DBC3 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cmtr1Q9DBC3 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cmtr1Q9DBC3 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cmtr1Q9DBC3 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cmtr1Q9DBC3 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cmtr1Q9DBC3 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cmtr1Q9DBC3 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cmtr1Q9DBC3 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cmtr1Q9DBC3 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cmtr1Q9DBC3 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cmtr1Q9DBC3 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cmtr1Q9DBC3 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cmtr1Q9DBC3 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cmtr1Q9DBC3 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cmtr1Q9DBC3 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cmtr1Q9DBC3 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cmtr1Q9DBC3 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cmtr1Q9DBC3 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cmtr1Q9DBC3 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cmtr1Q9DBC3 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cmtr1Q9DBC3 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cmtr1Q9DBC3 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cmtr1Q9DBC3 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cmtr1Q9DBC3 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cmtr1Q9DBC3 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cmtr1Q9DBC3 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cmtr1Q9DBC3 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cmtr1Q9DBC3 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cmtr1Q9DBC3 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cmtr1Q9DBC3 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cmtr1Q9DBC3 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cmtr1Q9DBC3 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cmtr1Q9DBC3 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cmtr1Q9DBC3 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cmtr1Q9DBC3 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cmtr1Q9DBC3 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cmtr1Q9DBC3 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cmtr1Q9DBC3 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cmtr1Q9DBC3 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cmtr1Q9DBC3 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cmtr1Q9DBC3 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cmtr1Q9DBC3 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cmtr1Q9DBC3 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cmtr1Q9DBC3 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cmtr1Q9DBC3 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cmtr1Q9DBC3 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cmtr1Q9DBC3 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cmtr1Q9DBC3 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cmtr1Q9DBC3 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cmtr1Q9DBC3 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Cmtr1Q9DBC3 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Cmtr1Q9DBC3 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cmtr1Q9DBC3 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cmtr1Q9DBC3 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cmtr1Q9DBC3 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cmtr1Q9DBC3 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cmtr1Q9DBC3 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cmtr1Q9DBC3 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cmtr1Q9DBC3 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cmtr1Q9DBC3 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cmtr1Q9DBC3 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cmtr1Q9DBC3 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cmtr1Q9DBC3 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cmtr1Q9DBC3 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cmtr1Q9DBC3 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cmtr1Q9DBC3 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cmtr1Q9DBC3 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cmtr1Q9DBC3 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cmtr1Q9DBC3 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cmtr1Q9DBC3 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cmtr1Q9DBC3 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cmtr1Q9DBC3 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cmtr1Q9DBC3 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cmtr1Q9DBC3 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Cmtr1Q9DBC3 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cmtr1Q9DBC3 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cmtr1Q9DBC3 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cmtr1Q9DBC3 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cmtr1Q9DBC3 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cmtr1Q9DBC3 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cmtr1Q9DBC3 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cmtr1Q9DBC3 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cmtr1Q9DBC3 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cmtr1Q9DBC3 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cmtr1Q9DBC3 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cmtr1Q9DBC3 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cmtr1Q9DBC3 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cmtr1Q9DBC3 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cmtr1Q9DBC3 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Cmtr1Q9DBC3 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cmtr1Q9DBC3 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cmtr1Q9DBC3 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms